ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
|
ИСТИНА ПсковГУ |
||
Проведен анализ факторов, определяющих формирование нуклеосомного барьера для транскрибирующей РНК полимеразы 2. Проведено исследование факторов, определяющих формирование нуклеосомного барьера для транскрибирующей РНК полимеразы 2. Разработаны методы молекулярной динамики для исследования механизма разворачивания октамера гистонов. Построена молекулярно-динамической модели октамера и нуклеосомы, а также проведено предварительное исследование динамических свойств моделей. Разработаны методы электронной микроскопии для исследования механизма разворачивания октамера гистонов. Проведен подбор условий для проведения исследований нуклеосомных комплексов с РНК полимеразой методом просвечивающей электронной микроскопии макромолекул. Подготовлены тестовые объекты к крио-электронномикроскопическому исследованию. Апробирован метод трехмерной ПЭМ для получения трехмерной структуры макромолекулярного комплекса с разрешением 2 нм. Разработаны методы атомно-силовой микроскопии для исследования механизма разворачивания октамера гистонов. Апробированы различные протоколы АСМ нанесения ДНК на слюду: с использованием ионов магния, с использованием полилизина и с использованием APS и др. Проведены предварительные испытания по оценке комплексов ДНК-белок, собранных на подложке. Разработаны методы конфокальной микроскопии и микроспектроскопии для исследования механизма разворачивания октамера гистонов . Отрабатываются методики детекции FRET от единичных комплексов, оптимизацией конструкции экспериментальных установок для таких измерений и проведением измерений FRET от единичных комплексов. Разработаны методоыисследования доменов инсуляторных белков, которые поддерживают дистанционные взаимодействия. Было проведено первичное исследование in vitro доменов инсуляторных белков, которые предположительно могут поддерживать дистанционные взаимодействия. Идентифицированы инсуляторные белки и их домены, участвующие в дистанционных взаимодействиях. Идентифицированы регуляторные белки из семейства ВТВ (в частности домен белка GAF), белки Mod(mdg4)-67.2 и Cp190, домены белков CTCF человека и его гомолога у дрозофилы (dCTCF), а также ZAD домены инсуляторных белков, Zw5. Проведено исследование регуляторных белков и их доменов. Работа по проекту была усилена включением научных групп под руководством к.ф.-м.н. А.К.Шайтана (компьютерное моделирование), к.ф.-м.н. Д.В.Багрова (сканирующая зондовая микроскопия), д.б.н., профессора А.В.Феофанова (конфокальная микроскопия), доцента, к.б.н. О.С.Соколовой (электронная микроскопия).