Модель расселения краснощеких сусликов (Spermophilus erythrogenys sensu lato), относящихся к различным гаплогруппам, построенная с помощью пакета программ BEAST v 1.8.0

Иванова, А.Д.; Соловьёва, Е.Н.; Сурин, В.Л.; Ермаков, О.А.; Формозов, Н.А.

Авторы: Иванова А.Д., Соловьёва Е.Н., Сурин В.Л., Ермаков О.А., Формозов Н.А.
Сборник: Генетика популяций: прогресс и перспективы. Материалы Международной научной конференции, посвященной 80-летию со дня рождения академика Ю.П. Алтухова (1936-2006) и 45-летию основания лаборатории плопуляционной генетики им. Ю.П. Алтухова ИОГен РАН
Тезисы
Год издания: 2017
Место издания: Ваш Формат Москва
Первая страница: 109
Последняя страница: 110
Аннотация: Под краснощеким сусликом в широком смысле (Spermophilus erythrogenys sensu lato) мы понимаем S. erythrogenys, S. brivicauda и др., с подвидами. Границы между различными формами строго не определены, и их таксономический статус остается до сих пор дискуссионным. Поскольку для сусликов этой группы характерна клинальная изменчивость морфологических признаков на большей части ареала, целесообразно исследовать их дифференциацию с помощью молекулярного маркера. Нами исследованы образцы из большой части ареала группы, расположенной в России и Казахстане. Источниками материала послужили коллекция Зоологического музея Алма-Аты, а также сборы из наших экспедиций 2013-2015гг. Последовательности других видов взяты из базы данных Genbank. Всего использовано 157 наших образцов и 42 последовательности из базы данных Genbank. В качестве маркера использован фрагмент контрольного региона мтДНК длиной 307-313пн (327 в выравнивании). Нуклеотидные последовательности и географические координаты точек сбора образцов обработаны в программе BEAST v1.8.0. с настройками: модель HKY+G для нуклеотидной партиции, часы strict clock и модель Homogenous Brownian для партиции координат, 50 млн. генераций; модель – HKY, часы strict clock, LRRW модель, tree prior - Coalescent: constant size, число генераций - 200 млн. Сходимость оценивали по ESS в программе Tracer v1.6. На основе полученных в программе BEAST данных в программе SPREAD v1.0.6 строилась модель расселения, затем визуализированная с помощью Google Earth. По маркеру контрольного региона внутри краснощёкого суслика в исследованном ареале выделены 6 подгрупп: типичный и кемеровский S. erythrogenys с разных берегов Оби, суслики южного берега оз. Зайсан и восточного берега оз. Алаколь, и три, условно названые нами iliensis, brevicauda, и carruthersi, обитающие вокруг оз. Балхаш. С помощью пакета программ BEAST удалось обнаружить исходный ареал краснощёких сусликов и построить модели распространения гаплотипов этой группы. Из области севернее оз. Балхаш расселение шло по трём направлениям: 1) на северо-восток, образуя популяции левого берега Оби; 2) на восток вдоль северного берега оз. Балхаш, далее разветвление на 3 ветви: а) на северо-восток – популяция правого берега Оби; б) на восток – популяции берегов озёр Зайсан и Алаколь; в) вокруг восточной оконечности озера Балхаш – carruthersi; 3) на запад вдоль северного берега оз. Балхаш и далее разветвляется на многочисленные ветви по территории Бетпак-Далы и Казахского мелкосопочника, одна из которых поворачивает назад и образует популяции северного берега озёр Балхаш и Зайсан - brevicauda, а другая огибает оз. Балхаш с запада – в составе последней расселялись, в основном, гаплотипы iliensis. Работа поддержана грантами РФФИ No 12-04-01804-а, No 15-34-20589
Добавил в систему: Соловьева Евгения Николаевна

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ПсковГУ
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ПсковГУ

Прикрепленные файлы