ФИЗИКО-ХИМИЧЕСКИЕ И СТРУКТУРНЫЕ СВОЙСТВА БЕЛКОВ ХРОМАТИНА ЧЕЛОВЕКА, ОПРЕДЕЛЯЮЩИЕ ФУНКЦИОНИРОВАНИЕ ГЕНОМА: АНАЛИЗ МЕТОДАМИ БИОИНФОРМАТИКИтезисы докладаТезисы
Аннотация:Хроматин — это комплекс ДНК и белков, обеспечивающий компактную упаковку генетического материала в ядре клетки. При этом хроматин играет ключевую роль в функционировании генома, участвуя в различных физико-химических процессах через ассоциированные с ним белки. К таким процессам относятся, например, ремоделирование хроматина за счет энергии АТФ, формирование функциональных немембранных конденсатов посредством слабых мультивалентных взаимодействий. Однако представление о разнообразии и свойствах белковой составляющей хроматина до сих пор остается неполным. В базах данных о локализации белков отсутствует консенсус относительно положения хроматина в онтологии ядерных субкомпартментов. При этом методами масс-спектрометрии идентифицируется от нескольких сотен до нескольких тысяч белков хроматина. Этот пробел затрудняет формирование целостного понимания механизмов функционирования генома. В рамках данной работы мы представляем современную характеристику белкового состава хроматина человека. Она основана на интеграции данных о локализации и функциях белков хроматина из различных источников и дополнена анализом их физико-химических свойств и доменной архитектуры. Для поддержки дальнейших исследований в этой области мы разработали интерактивный веб-ресурс SimChrom (https://simchrom.intbio.org/), который содержит результаты анализа источников информации о белках хроматина, предложенную упрощенную классификацию этих белков, а также списки референсных белков ядра и хроматина. Работа поддержана в рамках научной темы Министерства науки и высшего образования Российской Федерации “Полногеномный эпигенетический анализ как основа разработки генетических технологий профилактики и терапии ковида” (FFRW-2023-0007), регистрационный номер 123120500032-9. Исследование выполнено за счет грантов Российского (https://rscf.ru/en/project/25-14-00046/), (https://rscf.ru/en/project/23-74-10012/). А.К.Г. научного фонда поддержана #25-14-00046 #23-74-10012 фондом Геннадия Комиссарова.