Транскрипционные особенности аутоиммунного сахарного диабета: дифференциальная экспрессия генов в CD4+ и CD8+ субпопуляциях Т-клеток кровистатьяИсследовательская статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Аннотация:ОБОСНОВАНИЕ. Латентный аутоиммунный диабет взрослых (LADA, latent autoimmune diabetes mellitus in adults) рассматривается как промежуточная форма между сахарным диабетом 1 типа (СД1) и 2 типа (СД2), однако молекулярные механизмы, объясняющие его уникальные клинико-патогенетические особенности, остаются недостаточно изученными. Определение дифференциально экспрессируемых генов (ДЭГ) при LADA в сравнении с СД1 необходимо для разработки более персонифицированных подходов к диагностике и терапии.ЦЕЛЬ. Определить ДЭГ в периферических мононуклеарах крови у пациентов с LADA по сравнению с СД1, а также оценить отличия этих двух групп от здоровых добровольцев.МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ. В исследование включены 60 человек (23 пациента с СД1 длительностью до 1 года, 15 пациентов с LADA длительностью до 5 лет и 22 здоровых добровольца). Средний возраст пациентов с LADA составил 40 [34; 45] лет, с СД1 — 26 [21; 31] лет. Дизайн — одномоментное наблюдательное одноцентровое исследование. У всех участников выделяли периферические мононуклеары крови и выполняли секвенирование РНК одиночных клеток (scRNA-seq). Дифференциальный анализ экспрессии генов проводили с использованием «псевдобалкового» подхода (pyDEseq2, p<0,05 с поправкой на множественные сравнения, |log2FoldChange|≥0,5). Статистический анализ осуществляли с применением непараметрических критериев (Краскела–Уоллиса, Манна–Уитни).РЕЗУЛЬТАТЫ. У пациентов с LADA выявлено снижение экспрессии HLA-G, SPARC и C20orf204 и повышение AC002460.2 по сравнению со здоровыми добровольцами (p<0,05) в CD4+ наивных Т-клетках. В группе СД1 основные отличия касались CD4+ T клеток центральной памяти (IFIT1, CASP3, LAMP3, HIST1H2BN). При сравнении LADA и СД1 статистически значимо различался только один ген (C20orf204, p<0,05) в CD4+ наивных Т-клетках.ЗАКЛЮЧЕНИЕ. Полученные данные свидетельствуют о близости молекулярно-генетических паттернов LADA и СД1. У пациентов с LADA наблюдаются умеренные изменения в экспрессии ряда генов, связанных с иммунной регуляцией и воспалением. Минимальные различия между этими формами СД подчеркивают сходство патогенеза.