Конфликт филогенетического сигнала между ядерной рибосомной и пластомной ДНК как свидетельство гибридного происхождения тетраплоидного представителя Salicornia (Amaranthaceae s.l)статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Аннотация:Виды рода Salicornia (Amaranthaceae s.l.) широко распространены по всему миру и устойчивы к засолению. Они могут использоваться в пищу и для производства биотоплива. Образование чистых линий в результате самоопыления, наряду с возможностью спорадического перекрёстного опыления, полиплоидия, высокая степень морфологической пластичности и небольшое число диагностических признаков сильно затрудняют систематику рода. Salicornia – эволюционно молодая группа, где число накопленных информативных замен в традиционно анализируемых участках ядерной и пластидной ДНК оказалось недостаточным для установления родственных связей между видами, да и сама концепция вида в этом роде остаётся предметом дискуссий. Для уточнения взаимоотношений восточноевропейских видов мы впервые с помощью высокопроизводительного секвенирования определили последовательности и провели филогенетический анализ пластомов 11 образцов, представляющих все основные морфотипы солеросов Восточной Европы, а также проанализировали вариабельность внешнего транскрибируемого спейсера ядерной рДНК (nrETS). Размеры собранных пластомов варьировали от 153 290 п.н. до 153 504 п.н. и обладали типичной архитектурой с большой однокопийной областью (длиной 84 625–84 797 п.н.), малой однокопийной областью (длиной 18 818–18 870 п.н.) и двумя инвертированными повторами (длиной 24 898–24 908 п.н). Сравнение филогенетических деревьев, реконструированных по всем доступным на сегодняшний день для Salicornia пластомным данным и nrETS-выравниваниям одних и тех же образцов солеросов, выявило несоответствие в расположении образцов тетраплоидного S. procumbens subsp. pojarkovae и S. brachiata, которые показывают родство с разными эволюционными линиями в зависимости от использования пластидных или ядерных (nrETS) данных. Наши результаты подчёркивают роль сетчатой эволюции в роде Salicornia.