|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ПсковГУ |
||
Pathogenic potential of ornithogenic <i>Escherichia coli</i> strains detected in the Earth's polar regionsстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 1 октября 2025 г.
- Авторы: Aslanov Batyrbek I., Azarov Daniil V., Makarova Maria A., Marysheva Elizaveta G., Kraeva Lyudmila A., Mokhov Aleksey S., Lebedeva Ekaterina A., Goncharov Nikita E., Lebedeva Natalya V., Starikov Dmitry A., Kolodzhieva Victoria V., Polev Dmitry E., Goncharov Artemy E.
- Журнал: Журнал микробиологии, эпидемиологии и иммунобиологии
- Том: 101
- Номер: 6
- Год издания: 2024
- Первая страница: 758
- Последняя страница: 768
- DOI: 10.36233/0372-9311-607
- Аннотация: Введение. Патогенные штаммы Escherichia coli являются важным объектом мониторинга в природе, сельском хозяйстве и человеческом обществе в рамках концепции «Единого здоровья». Колонии мигрирующих птиц и птичьи базары в высоких широтах могут быть точками активных внутривидовых и межвидовых контактов между различными видами животных, сопровождающихся распространением микроорганизмов. В то же время филогеография E. coli в контексте наличия природных очагов колибактериозов в полярных регионах практически не изучалась. Цель работы: оценка патогенного потенциала штаммов E. coli, распространённых в полярных регионах Земли, на основе анализа геномов данных бактерий из выборки, характеризующей типичные орнитогенные экосистемы Арктики и Антарктики. Материалы и методы. В работе были использованы штаммы E. coli, выделенные из орнитогенного биологического материала в ходе экспедиций на высокоширотные территории Арктики (архипелаги Новая Земля, Земля Франца-Иосифа, Шпицберген) и Антарктики (архипелаг Хасуэлл). Из них 16 штаммов, ассоциированных с птицами (12 полярных штаммов и 4 штамма, выделенных в умеренных широтах), были отобраны для полногеномного секвенирования с использованием технологии BGI. Аннотирование геномов было сфокусировано на идентификации генов, кодирующих факторы патогенности и устойчивости к антимикробным препаратам, а также на определении принадлежности штаммов к отдельным серотипам и генетическим линиям, в том числе на основе использования метода cgMLST. Результаты. Проведённое аннотирование геномов E. coli позволило установить их принадлежность к различным сиквенс-типам в схемах мультилокусного секвенирования-типирования и полногеномного секвенирования-типирования. Анализ географического распространения сиквенс-типов «полярных» штаммов E. coli, определённых методом cgMLST, продемонстрировал их глобальную представленность. Так, например, cgST 133718 был отмечен в Антарктиде (штамм 17_1myr) и ранее - в Великобритании, а сиквенс-тип 11903, к которому принадлежал штамм 32-1 из самой северной точки Новой Земли, был ранее выявлен в США. Все изученные штаммы характеризовались наличием обширного вирулома. В числе выявленных генов факторов патогенности обнаружены гены гемолизинов A, E, F, сидерофоры, включая иерсиниабактиновый кластер генов, ряд генов факторов адгезии, колонизации и инвазии, а также ген термостабильного энтеротоксина EAST-1 и гены, маркирующие энтероаггрегативные штаммы E. coli: ген регулятора вирулентности eilA и энтероаггрегативный белок (air). Один из «арктических» штаммов (33-1) характеризовался наличием детерминант устойчивости к антибиотикам, в частности, в его геноме был детектирован ген бета-лактамазы расширенного спектра TEM-1b и транспозон Tn1721, включающий гены устойчивости к тетрациклинам (tetA-tetR). Заключение. Результаты исследования свидетельствуют о циркуляции в орнитогенных экосистемах высокоширотной Арктики и Антарктики штаммов E. coli, обладающих выраженным патогенным потенциалом. Анализ геномных данных свидетельствует о распространении в этих регионах генетических линий, широко географически представленных, что обосновывает значимость мониторинга эпидемических клонов кишечной палочки, наряду с мониторингом других патогенов, в колониях массовых видов птиц на высокоширотных территориях.
- Добавил в систему: Лебедева Наталья Викторовна