Аннотация:Трансляция является мишенью для действия различных ингибиторов,способных связываться с функциональными центрами рибосомы и блокироватьеё на разных этапах, приводя к остановке роста или гибели клеток. До недавнеговремени такие ингибиторы считались универсальными. Но с появлением новыхвысокопроизводительных методов парадигма изменилась. Нашли ингибиторы,обладающие выраженной специфичностью в отношении последовательности мРНК,кодирующей синтезируемый белок.С применением разных широкомасштабных методов (Ribo-seq, iTP-seq, STALL-seq) знания о сиквенс-специфичности ингибиторов трансляции активнонакапливаются. Каждый из этих подходов сочетает в себе выявление тем или инымспособом фрагментов мРНК, защищённых рибосомой ввиду остановки, вызванной вовремя трансляции действием ингибитора, с последующим высокопроизводительнымсеквенированием (NGS) данных фрагментов.Разнообразие таких подходов дополняет новый метод Toe-seq, разработанный внашей лаборатории и представляющий собой сочетание классического тоупринтинга,адаптированного для работы с большими библиотеками матриц мРНК (порядка 10^4), иNGS. Данный метод позволяет анализировать места остановки рибосомы, вызванныеприсутствием ингибитора трансляции, особенностями матрицы и процесса биосинтезабелка. Он уже применен для ряда антибиотиков, для которых выявлена подтвержденнаясиквенс-специфичность. Данный подход прольёт новый свет в детальное изучениемолекулярных основ механизма действия антибиотиков и возможно в открытие новыхнаправлений в решении проблемы активного развития резистентности к ним.
