|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ПсковГУ |
||
Моделирование взаимодействия фотосистемы i с белками переносчиками электрона методом броуновской динамикитезисы доклада
- Авторы: Вольхин И.А., Федоров В.А., Хрущев С.С., Коваленко И.Б.
- Сборник: Математическое моделирование систем и процессов. Сборник тезисов до- кладов Международной научно-практической конференции
- Тезисы
- Год издания: 2023
- Издательство: Псковский государственный университет
- Местоположение издательства: Псков
- Первая страница: 10
- Последняя страница: 11
- Аннотация: Пластоцианин и цитохром c6 — белки-переносчики электронов в электронтранспортной цепи цианобактерий и хлоропластов, осуществляющие перенос электрона от цитохрома f цитохром-b6f-комплекса на фотосистему I. В то время как у зелёных водорослей в фотосинтезе могут принимать участие оба белка, у высших растений на это способен только пластоцианин. Мы полагаем, что взаимодействие белка – подвижного переносчика электронов с мультиферментным комплексом можно условно разделить на несколько этапов. Предполагается, что на первом этапе взаимодействия белок-переносчик диффундирует под действием случайных броуновских сил и электростатических взаимодействий с фотосистемой. Результатом диффузии является формирование столкновительного комплекса, который затем может перейти в финальный комплекс, в котором возможен туннельный перенос электрона. Разные этапы этого процесса происходят на разных временных масштабах и требуют различных подходов к описанию. В данной работе мы исследуем процесс формирования столкновительного комплекса белков-переносчиков с фотосистемой I методом броуновской динамики. Особенность данного метода молекулярного моделирования заключается в том, что белок рассматривается как твёрдое тело, движущееся в вязкой среде растворителя согласно уравнениям Ланжевена. Молекулы растворителя и ионы заданы неявно и их влияние на электростатическое взаимодействие между белками учитывается с помощью расчёта электростатического потенциального поля по уравнению Пуассона-Больцмана. Моделирование броуновской динамики осуществлялось в программе ProKSim.
- Добавил в систему: Хрущев Сергей Сергеевич