Лиганды специфичные к определенным последовательностям пар оснований ДНК. XIII. Новые димерные молекулы Хёхста 33258. Синтез, взаимодействие с ДНК, ингибирование интегразы ВИЧ-1статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 26 декабря 2017 г.
Аннотация:Методами компьютерного моделирования сконструированы димерные молекулы Хёхста 33258 – димерные бисбензимидазолы (DBBI), занимающие при связывании в узкой бороздке один виток В-формы ДНК. Синтезированы три флуоресцентных DBBI, состоящие из двух бисбензимидазольных блоков, связанных «хвост-к-хвосту» через фенольные гидроксильные группы пента-, гептаметиленовыми или триэтиленгликолевым мостиками и имеющие на концах молекулы положительно заряженные N,N-диметиламинопропилкарбоксамидные группы. В спектрах поглощения DBBI в присутствии разных концентраций ДНК наблюдаются гипохромный эффект и небольшой сдвиг полосы поглощения в длинноволновую область спектра, свидетельствующий об образовании комплекса с ДНК. Наличие в спектре изобестической точки указывает на образование одного типа комплекса DBBI–ДНК. Методом КД исследовано взаимодействие DBBI с ДНК с использованием холестерической жидкокристаллической дисперсии (ХЖД) ДНК. Появление в КД-спектре ХЖД ДНК положительной полосы в области поглощения хромофоров лиганда свидетельствует об образовании комплекса DBBI–ДНК, в котором хромофоры лиганда располагаются по отношению к спиральной оси ДНК под углом, близким к 54º, что свидетельствует о локализации DBBI в узкой бороздке ДНК. Обнаружено, что все DBBI являются in vitro ингибиторами ДНК-интегразы ВИЧ-1 в реакции 3’-процессинга, причем два из трех синтезированных DBBI ингибируют интегразу ВИЧ-1 уже в субмикромолярных концентрациях.