|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ПсковГУ |
||
Изучение молекулярных механизмов функционирования вирусных и клеточных мРНКНИР
Investigation of the molecular mechanisms underlying the functions of viral and cellular mRNAs
- Руководитель НИР: Дмитриев С.Е.
- Участники НИР: Головко В.А., Замятнина К.А., Иванов Л.А., Каримова К.М., Кметь В.А., Коноплева М.В., Кущенко А.С., Мудрик Н.Н., Нурмухомятова Э.Р., Самарский А.Е., Стафеева А.Г., Строколист В.В., Сухинина А.П., Трошин Б.А., Тышковский А.Э., Федоровский А.Г., Фейгин С.Е.
- Подразделение: Отдел взаимодействия вирусов с клеткой
- Срок исполнения: 1 января 2026 г. - 31 декабря 2029 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 21870-П8-ДЧ
- Номер ЦИТИС: 126032519259-1
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Структура и функционирование клетки. Межклеточные взаимодействия. Молекулярные механизмы клеточной дифференцировки, иммунитета и онкогенеза. Взаимодействие вирус-клетка.
- Приоритеты и перспективы НТР Российской Федерации согласно Стратегии НТР РФ: переход к высокотехнологичному здравоохранению и технологиям здоровьесбережения
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
- Критическая технология России: Геномные, протеомные и постгеномные технологии
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.15.15 Пространственная структура и свойства биополимеров
- 34.15.17 Макромолекулярные ассоциации и проблемы узнавания в молекулярной биологии
- 34.15.23 Молекулярная генетика
- 34.15.25 Молекулярная биология гена
- 34.15.27 Генетическая инженерия
- 34.15.31 Молекулярная биология вирусов
- 34.15.49 Молекулярная биология развития и старения
- 34.15.51 Молекулярная онкология
- 34.25.19 Репликация вирусов
- 34.25.21 Генетика вирусов
- 34.43.35 Регуляция иммунного ответа
- 34.45.05 Методы доклинического исследования и отбора лекарственных средств
- 62.37.35 Вакцины, полученные методом генетической инженерии
- 62.37.99 Другие проблемы генетической инженерии
- 76.31.29 Клиническая фармакология
- Классификатор OECD: Биохимия и молекулярная биология, Клеточная и тканевая инженерия, Фармакология и фармацевтика, Биотехнологии в медицине, Вирусология
-
Ключевые слова:
регуляция трансляции, биология старения и продолжительности жизни, репортерные мрнк, рнк-содержащие вирусы, регуляторные элементы клеточных и вирусных мрнк, мрнк-технологии, рибосома, crispr-опосредованный генетический скрининг, биосинтез белка, врожденный клеточный иммунитет, транскриптомные сигнатуры, вирусные репликоны, разработка мрнк-платформ, мрнк-вакцины, антибиотики, терапевтические мрнк, геномное редактирование, низкомолекулярные ингибиторы биосинтеза белка, взаимодействие вирусов с клеткой
crispr-screening, small-molecule inhibitors of protein synthesis, viral replicons, mrna technologies, antibiotics, rna viruses, translational control, development of mrna platforms, therapeutic mrnas, reporter mrnas, biology of aging and longevity., innate immune response, virus-cell interaction, regulatory elements of cellular and viral mrnas, ribosome, mrna vaccines, protein synthesis, genome editing, transcriptome signatures -
Описание:
Изучить молекулярные механизмы трансляции и стабильности вирусных и клеточных мРНК методами молекулярной и клеточной биологии, осуществить идентификацию структурных элементов, обеспечивающих их функционирование, и поиск нужных для этого генов, а также разработать экспериментальные системы для углублённого исследования таких механизмов
-
Abstract:
The project aims to investigate the molecular mechanisms controlling viral and cellular mRNA translation and stability, identify the key structural elements and genes involved, and develop advanced experimental systems for their functional analysis.
-
Планируемые результаты:
Будут изготовлены молекулярно-генетические конструкции, кодирующие структурные элементы вирусных и клеточных мРНК, методом CRISPR-Cas будут получены линии клеток человека, нокаутные по генам, чьи продукты задействованы в регуляции трансляции мРНК с такими элементами, а экспрессия соответствующих синтетических репортерных мРНК будет проанализирована методами мРНК-трансфекции этих линий и in vitro трансляции в соответствующих бесклеточных системах. С помощью нокаутирующего CRISPR-скрининга будет идентифицирован ряд генов человека и животных, необходимых для неканонических механизмов работы вирусных и клеточных мРНК. Будут изготовлены репортерные конструкции для изучения структурных элементов, обеспечивающих функционирование вирусных и клеточных мРНК в клетках млекопитающих, а также сконструированы вирусные репликоны и репортерные конструкции с их фрагментами, затем с помощью этих конструкций будут получены синтетические мРНК, эффективность трансляции которых будет проанализирована в культивируемых клетках млекопитающих методом мРНК-трансфекции.
-
Научный задел:
У коллектива имеется существенный научный задел в виде освоенных методик, собранных материалов, а по некоторым направлениям – результатов проведённых пилотных экспериментов. Создано несколько типов моно- и бицистронных векторов для анализа функциональной активности структурных элементов РНК и для проведения генетических нокаутов, получены препараты кДНК на основе клеточных и вирусных РНК, наработаны библиотеки для проведения CRISPR-скрининга на клетках человека и мыши, собрана коллекция клеточных линий различной этиологии, разработаны методы получения различных типов бесклеточных трансляционных систем. Успешно проведено несколько CRISPR-скринингов по смежным тематикам, есть солидный опыт в получении нокаутных клеточных линий. Разработаны, созданы и протестированы (в сотрудничестве с другими организациями) платформы для мРНК-вакцин - опыт, который позволяет проектировать новые аналогичные платформы, усовершенствовать их и применять для новых приложений. В том числе прикладной направленности. Создана база данных ингибиторов эукариотической трансляции. Разработаны биоинформатические алгоритмы для анализа и метаанализа данных транскриптома и рибосомного профайлинга, создания транскрипционных сигнатур, транскриптомных и эпигенетических «часов старения».
- Добавил в систему: Дмитриев Сергей Евгеньевич
Источник финансирования НИР
| госбюджет, раздел 0110 (для тем по госзаданию) |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2026 г.-31 декабря 2026 г. | Изучение молекулярных механизмов функционирования вирусных и клеточных мРНК |
| Результаты этапа: - | ||
| 2 | 1 января 2027 г.-31 декабря 2027 г. | Изучение молекулярных механизмов функционирования вирусных и клеточных мРНК |
| Результаты этапа: - | ||
| 3 | 1 января 2028 г.-31 декабря 2028 г. | Изучение молекулярных механизмов функционирования вирусных и клеточных мРНК |
| Результаты этапа: - | ||
| 4 | 1 января 2029 г.-31 декабря 2029 г. | Изучение молекулярных механизмов функционирования вирусных и клеточных мРНК |
| Результаты этапа: - | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".