ИСТИНА

Теоретические и экспериментальные исследования выявили большой потенциал рационального применения галогенового связывания в разработке лекарств. Однако на данный момент отсутствуют надежные и высокопроизводительные средства для моделирования галогенового связывания для сложных органических молекул, что препятствует целенаправленному использованию этих взаимодействий на стадии компьютерного конструирования новых лекарственных веществ. Известно, что энергия галогенового связывания зависит от электроноакцепторности заместителей при галогенсодержащем фрагменте. Количественный учет такого влияния в настоящее время возможен только при помощи ресурсоемких квантово-химических расчетов. Одним из важных инструментов компьютерной предклинической разработки лекарств является высокопроизводительный молекулярный докинг, в котором подбирается оптимальная позиция связывания исследуемого соединения с биологической мишенью. Мерой эффективности связывания служат так называемые оценочные функции, позволяющие быстро получить численные оценки свободной энергии связывания. На данный момент оценочные функции не учитывают явным образом галогенового связывания, что затрудняет их применение при разработке новых лекарственных веществ, содержащих тяжелые атомы галогена. Во многом это связано с отсутствием количественных моделей, связывающих характеристики галогенового связывания с молекулярной структурой лиганда. Таким образом, актуальными являются две задачи. Во-первых, исследование зависимости «силы» галогенового связывания от свойств заместителей в разнообразных органических соединениях и выработка эмпирической зависимости, воспроизводящей наблюдаемое поведение. Во-вторых, разработка методов описания галогенового связывания в молекулярном докинге, а также валидация разработанных подходов при помощи проведения молекулярного докинга лигандов, для которых экспериментально установлено наличие галогенового связывания с белковой мишенью.

Theoretical and experimental studies have shown the great potential of rational use of halogen binding in drug development. However, at the moment there are no reliable and high-performance tools for modeling halogen binding to complex organic molecules, which prevents the purposeful use of these interactions on the stage of computer design of new drugs. It is known that halogen binding energy depends on the electron-withdrawing substituents on the halogen-containing fragment. Quantitative accounting of such influence is currently only possible with the help of intensive quantum chemical calculations. One of the important tools of computer preclinical drug development is a high molecular docking, which selects the optimal position of the binding of the test compound with a biological target. Measure the effectiveness of binding are called estimators to quickly obtain numerical estimates of the free energy of binding. Currently, evaluation function explicitly ignore halogen binding, making them difficult to use in the development of new drugs containing heavy halogen atoms. This is largely due to the lack of quantitative models linking the characteristics of halogen binding to the molecular structure of the ligand. Thus two tasks are relevant. Firstly, according to the study "force" halogen binding properties of a variety of substituents in organic compounds and the development of an empirical relationship that reproduces the observed behavior. Secondly, the development of halogen binding describe methods in molecular docking and validation approaches developed by means of molecular docking ligands for which experimentally established the existence of halogen binding to the target protein.

Исследование зависимости «силы» галогенового связывания от свойств заместителей в разнообразных органических соединениях и выработка эмпирической зависимости, воспроизводящей наблюдаемое поведение. Разработка методов описания галогенового связывания в молекулярном докинге, а также валидация разработанных подходов при помощи проведения молекулярного докинга лигандов, для которых экспериментально установлено наличие галогенового связывания с белковой мишенью.

Исследование зависимости «силы» галогенового связывания от свойств заместителей в разнообразных органических соединениях и выработка эмпирической зависимости, воспроизводящей наблюдаемое поведение. Разработка методов описания галогенового связывания в молекулярном докинге, а также валидация разработанных подходов при помощи проведения молекулярного докинга лигандов, для которых экспериментально установлено наличие галогенового связывания с белковой мишенью.