ИСТИНА

Нематоды (круглые черви) – это самые распространенные животные планеты: из пяти произвольно взятых особей животных четверо окажутся нематодами. Нематоды обитают в морских и пресноводных осадках, микротрещинах морского льда, почве, телах животных и растений, даже в крупных одноклеточных, интенсивно взаимодействуют с другими организмами в трофических сетях, участвуют в разложении органических остатков, круговороте углерода и нутриентов. Их влияние на морские, пресноводные, почвенные и наземные сообщества имеет глобальный, системообразующий характер, оставаясь при этом недостаточно изученным. Актуальной является задача выявления абиотических и особенно биотических регуляторов численности нематод. В проекте предлагается новое решение – современными методами высокопроизводительного секвенирования найти и идентифицировать симбионтов, паразитов и паразитоидов – потенциальных регуляторов численности нематод. Наши предварительные данные свидетельствуют о присутствии в живых нематодах различных микроорганизмов, а это позволяет предполагать, что нематоды представляют в экосистемах ниши для скрытого разнообразия патогенов (грибов, протистов, бактерий) с пока не осознанным потенциалом. Разнообразие симбионтов планируется выявить в метагеномах зараженных нематод, а также путем ультраструктурных исследований. Для комплексного использования метагеномных данных, обобщения сведений по найденным ассоциациям с патогенами-регуляторами, а также в приложении к нематодам - объектам медицинского и хозяйственного значения, в проекте решается связанная задача развития сравнительной геномики нематод и ассоциированных с ними микроорганизмов. Нематоды важны для молекулярной биологии, генетики, биологии развития как традиционные модельные виды (Caenorhabditis elegans – первое животное с расшифрованным ядерным геномом), но все модельные виды принадлежат к одной, чрезвычайно успешной, но компактной группе (Rhabditia, ранее Secernentea). Такое их эволюционное положение означает, что они сильно специализированы. Это проявляется в том, что по многим особенностям метаболизма и функциональной геномики модельные виды нематод сложно сопоставлять с другими животными без знания переходных форм. В ходе проекта модельные виды будут помещены в более широкий контекст сравнительной геномики, что повысит эффективность применения сведений по ним в разных областях молекулярной и клеточной биологии. Для этого будут получены новые данные по видам из малоизвестных реликтовых таксонов, по которым в распоряжении коллектива есть уникальный материал; будет сконструировано филогеномное дерево, на которое картированы морфологические и экологические признаки. Полученные в проекте данные (метагеномные, геномные и транскриптомные) будут размещены в доступных электронных базах и расширят молекулярно-генетические сведения по нематодам, что остро необходимо ввиду глобального биосферного, медицинского и экономического значения этих животных.