Изучение резистентности возбудителей и разработка персонифицированных подходов к выбору и назначению противомикробных препаратовНИР

The study of resistance of pathogens and the development of personalized approaches to the selection and prescription of antimicrobials

Источник финансирования НИР

госбюджет, раздел 0908 (здравоохранение, для тем по госзаданию)

Этапы НИР

# Сроки Название
1 1 января 2023 г.-31 декабря 2023 г. Изучение резистентности возбудителей и разработка персонифицированных подходов к выбору и назначению противомикробных препаратов
Результаты этапа: Объектом исследования являются: - клинически значимые резистентные возбудители инфекционных со-стояний. К числу наиболее часто встречающихся и сложно поддающихся лечению относятся инфекционные заболевания, состояния вызванные Klebsiella pneumoniae, Klebsiella oxytoca, Pseudomonas aeruginosa, Acinetobacter baumanni и MRSA (Methicillin-resistant Staphylococcus aureus); - противомикробные препараты, их спектр действия, дозы, кратность назначения при заболеваниях, состояниях инфекционного генеза; Участниками исследований являются пациенты и сотрудники Меди-цинского научно-образовательного центра МГУ имени М.В.Ломоносова. Цель данного научного исследования - изучение устойчивости (рези-стентности) клинически значимых микроорганизмов к противомикробным препаратам на основе комплексного мониторинга циркуляции резистентных штаммов и потребления противомикробных препаратов в условиях много-профильной медицинской организации, определение подходов к персонифицированному выбору и назначению противомикробных препаратов с учетом комплексного мониторинга. В ходе проведения использовались: клинические, инструментальные методы диагностики, лабораторно-диагностические, включая микроскопические, микробиологические методы с определением чувствительности возбудителей к противомикробным препаратам, микроорганизмы с признаками резистентности исследуются дополнительно с применением молекулярно-генетических методов диагностики. В ходе выполнения НИР получены следующие научные результаты: 1) Проведен анализ резистентности возбудителей в условиях медицинской организации на основе коллекции изолятов бактерий, выделенных у больных с симптомами инфекции, находившихся на стационарном лечении в отделениях медицинской организации (2021-2023гг.). В результате исследования данного раздела опубликованы в качестве тезисов и представлены в постерном докладе (Коробова А.Г., Кириллова К.И., Трушина Е.Е., Самоходская Л.М. Антибиотикорезистентность возбудителей инфекций мочевых путей в многопрофильном стационаре. Клиническая микробиология и антимикробная химиотерапия, 2023). 2) Разработана междисциплинарная образовательная программа «Во-просы резистентности возбудителей и рациональное применение противо-микробных препаратов в клинической практике» для врачей – специалистов. 3) Началась реализация 1 фазы исследования «Микробиологическая структура патогенных и условно-патогенных микроорганизмов нижних отделов женской половой системы по данным профилактического медицинского осмотра сотрудников».
2 1 января 2024 г.-31 декабря 2024 г. Изучение резистентности возбудителей и разработка персонифицированных подходов к выбору и назначению противомикробных препаратов
Результаты этапа: 1) Проведен комплексный анализ резистентности возбудителей, включая молекулярно-генетические исследования, в условиях медицинской организации на основе коллекции изолятов бактерий, выделенных у больных с симптомами инфекции, находившихся на стационарном лечении в отделениях медицинской организации. 2) Подготовлена структура и начато формирование электронной базы данных резистентности возбудителей, выделенных у больных с симптомами инфекции, находившихся на стационарном лечении в отделениях медицинской организации. Электронная база станет частью системы Комплексного мониторинга циркуляции резистентных штаммов и потребления противомикробных препаратов в условиях многопрофильной медицинской организации. 3) Осуществлен набор данных в рамках протокола с анкетированием пациентов «Микробиологическая структура патогенных и условно-патогенных микроорганизмов нижних отделов женской половой системы по данным профилактического медицинского осмотра сотрудников» (n=132) Проведен предварительный статистический анализ данных, собран биологический материал для проведения молекулярно-генетических исследований. 4) Проведен анализ данных результатов цитологических и микробиологических исследований сотрудников, обследованных во время профилактического медицинского осмотра (n=132). Получены предварительные данные по структуре инфекционных агентов, полученных из биологического материала нижних отделов женской половой системы. 5) Разработан технический макет «Карты противомикробной профилактики и терапии». 6) Подготовлена научная работа по теме «Состояние вагинального микробиоценоза в различных возрастных группах» (защита курсовой работы). В рамках работы по изучению резистентности к антибиотикам лаборатория микробиологии участвует в многоцентровых исследованиях, проводимых межрегиональной ассоциацией по клинической микробиологии и антимикробной химиотерапии (КМАХ) «Мониторинг распространенности и антибиотикорезистентности возбудителей инфекций в многопрофильных стационарах различных регионов России (МАРАФОН-2024)» (Договор о научном сотрудничестве в области исследований чувствительности микроорганизмов к антимикробным препаратам от 01.02.2024). По результатам выполнения работ второго этапа НИР можно сделать следующие выводы: 1. Преобладание госпитальных инфекций над внебольничными, вероятно, связано с особенностями медицинской деятельности стационара, так большая часть больных поступает в стационар на плановые хирургические вмешательства по поводу онкологических заболеваний без явных симптомов инфекции, а также значительная часть операций связана с нарушением целостности мочевыводящих путей и стенки желудочно-кишечного тракта, что является фактором риска развития эндогенной инфекции связанной с медицинской помощью. 2. Очевидно, что даже при соблюдении программ инфекционного контроля, существует базовый риск развития госпитальных инфекций, поэтому для более эффективного и быстрого принятия клинических решений необходимо владеть информацией об этиологической структуре возбудителей госпитальных инфекций и спектре активности антимикробных препаратов, характерных для конкретного учреждения. 3. Спектр 10 наиболее распространённых клинически значимых микроорганизмов, выделенных в 2021-2023 гг., представлен ведущими микроорганизмами E. coli (28,65%), далее следовали K. pneumoniae (14,81%), E. faecalis (11,15%), реже выявляли P. aeruginosa (6,92%), Enterococcus faecium (6,35%), S. aureus (5,96%), P. mirabilis (4,04%), E. cloacae complex (3,46%), A. baumannii (2,31%), доля других микроорганизмов составила 16,35%. 3.1.В общем спектре возбудителей преобладали E. coli, K. pneumoniae, E. faecalis. Высокий процент выделения Enterobacterales (54,23%) в ходе исследования обусловлен значительной долей пациентов с инфекциями мочевыводящей системы и интраабдоминальными инфекциями, что соответствует основным специализациям стационара. 3.2. Доля CPE среди всех выделенных энтеробактерий составила 12,6%, преобладали K. pneumoniae (87,5%, n=28), также были выделены E. coli (6,3%, n=2), P. stuartii (3,1%, n=1), E. cloacae complex (3,1%, n=1). У значительной части CPE были определены гены металло-беталактамаз типа NDM (изолированно – 43,75%, в сочетании с OXA-48 – 18,75%, с KPC – 3,13%), реже выявляли гены карбапенемаз типа OXA-48 (изолированно – 15,63%, с NDM – 18,75%, с KPC – 3,13%) и KPC (изолированно – 15,63%). Среди исследованных изолятов отмечался высокий процент устойчивости как беталактамным антибиотикам - цефалоспоринам (100%), карбапенемам (87,5%), азтеронаму (87,5%) и цефтазимиму-авибактаму (75%), так и к небеталактамным препаратам - фторхинолонам (96,8%), фосфомицину (78%), амикацину (77,4%). 3.3.. Литическая активность исследованных препаратов бактериофагов в отношении K. pneumoniae была ниже 50%, при очевидном преимуществе препарата узкого спектра действия (Клебсифаг) по сравнению поливалентным бактериофагом - 43,6% и 21,8% соответственно. Большая активность “Клебсифага” в отношении полирезистенных изолятов по сравнению с чувствительными к антибиотикам позволяет надеяться на эффективность бактериофагов в отношении трудно поддающиеся антибактериальной терапии бактерий. 3.4.Чувствительными ко всем изученным антибиотикам были только 45,5% штаммов P. aeruginosa, тогда как полная резистентность была у 21,21%. Достаточный уровень активности для эффективной фаговой терапии был еще ниже для препаратов бактериофагов с заявленной активностью в отношении P. aeruginosa и не превышал 22%. 3.5. Среди энтеробактерий устойчивыми к цефотаксиму были 48,68% изолятов, к фторхинолонам – 34,94%. Продуцентами БЛРС были 40% Enterobacterales, карбапенемаз – 2,35%. У всех продуцентов карбапенемаз были металлобеталактамазы NDM. 3.6. В спектре возбудителей интраабдоминальных инфекций преобладали энтеробактерии, среди них устойчивыми к цефалоспоринам были около 50% изолятов, к фторхинолонам - 34,94%, активность карбапенемов превышала 97%. 3.7. В 2021-2023 году было выявлено 12 изолятов A. baumannii. Все изоляты были устойчивыми к карбапенемам, фторхинолонам, чувствительность к триметоприму-сульфаметаксазолу была отмечена у 90,91%, к амикацину у 85,71%, к гентамицину у 36,36% изолятов. У 11 A. baumannii были определены гены карбапенемаз, у восьми изолятов детектированы гены карбапенемазы типа OXA-23, у трех – OXA-40. 3.8. Среди E. faecium резистентными к ампициллину были 100% изолятов, также отмечался высокий уровень резистентности к фторхинолонам (79,31%) и аминогликозидам (к гентамицину – 70,59% и к степромицину – 23,08%). Следует отметить, что было выявлено восемь устойчивых к ванкомицину изолятов E. faecium (24,24%) и один устойчивый к линезолиду. Гены устойчивости к гликопептидам определяли у 7 E. faecium, у всех выявлен ген vanA. 3.9. Большая часть клинически значимых изолятов Staphylococcus spp., выделенных в 2021-2023 годах, относилась к S. aureus (73,81%, 31 из 42). Среди всех Staphylococcus spp. устойчивыми к оксациллину или цефокситину были 21,43% (n=9), среди них S. epidermidis (n=5), S. aureus (n=2), S. schleiferi (n=1), S. lugdunensis (n=1), гены mecA были определены у 7 изолятов. Устойчивыми к фторхинолонам были 20,6% изолятов. 3.10. Статистически значимых изменений в доле продуцентов БЛРС и карбапенемаз за период исследования отмечено не было (p>0,05). Однако можно заметить, что доля Enterobacterales с продукцией БЛРС в отделениях терапевтического профиля за 3 года выросла на 18,26% от исходных 21,74%, а доля продуцентов карбапенемаз в отделениях хирургического профиля за 3 года снизилась на 4,83% от исходных 13,16%. 4. В ходе выполнения НИР (n - 132) нами были изучены особенности вагинального микробиоценоза в различных возрастных группах: 4.1.Полученные в ходе исследования данные о составе микрофлоры влагалища в различных возрастных группах в целом соответствовал литературным данным, что позволило говорить о репрезентативности выборки. 4.2. Изучив особенности состава микробиоты, мы отметили, что существуют значимые различия в отношении представительства микрофлоры. Показано, что в возрастной группе 20-29 лет, а также 30-39 лет и 40-49 лет преобладает, в основном, палочковая флора. 4.3. Исследование показало, что, начиная с возраста женщин 40-49 лет, отмечается рост кокков в мазке, при этом, в старших возрастных группах кокковая флора является преобладающей. Более того, среди женщин старшего возраста чаще отмечается аэробный вагинит. 4.4. В ходе выполнения работы было сформировано представление об особенностях микробиоценоза влагалища у пациенток различных возрастных групп, а также выявлены и оценены различия в характеристиках влагалищного мазка. 4.5. На основании полученных данных можно говорить о важности своевременно и верно подобранной схемы лечения, а также продолжении терапии в виде второго этапа, на котором предполагается введение лактобактерий интравагинально с целью коррекции микробиоценоза влагалища.
3 1 января 2025 г.-31 декабря 2025 г. Изучение резистентности возбудителей и разработка персонифицированных подходов к выбору и назначению противомикробных препаратов
Результаты этапа:
4 1 января 2026 г.-31 декабря 2026 г. Изучение резистентности возбудителей и разработка персонифицированных подходов к выбору и назначению противомикробных препаратов
Результаты этапа:

Прикрепленные к НИР результаты

Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".

Прикрепленные файлы

№ Имя Описание Имя файла Размер Добавлен