![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ПсковГУ |
||
Некаталитическое [3+2]-циклоприсоединение с органическими азидами, SPAAC (strain-promoted azide alkyne cycloaddition), зарекомендовало себя в качестве мощного химического инструмента с широким диапазоном применения. SPAAC, в отличие от “клик-реакций” CuAAC, позволяет обойтись без применения в качестве катализаторов соединений одновалентной меди, токсичных для живых клеток. Это является преимуществом для проведения биологических исследований. Основной проблемой является работа с малоустойчивыми циклоалкинами. Целью настоящего исследования является синтез и применение для SPAAC таких циклоалкинов, которые сочетают стабильность и высокую реакционную способность.
Non-catalytic [3+2]-cycloaddition with organic azides, SPAAC (strain-promoted azide alkyne cycloaddition), has proven itself as a powerful chemical tool with a wide range of applications. SPAAC, in contrast to the CuAAC ”click reactions", does not require the use of monovalent copper compounds as catalysts which are toxic to living cells. This is an advantage for conducting biological research. The main problem is necessity to work with low-stable cycloalkynes. The aim of this study is to synthesize and use for SPAAC such cycloalkynes that combine stability and high reactivity.
Данный проект направлен на разработку эффективного (короткостадийного) подхода к синтезу высоко реакционоспособных циклоалкинов или бинарных систем, которые приводили бы к циклоалкинам. Планируется реализовать данный подход на основе доступных предшественников, избегая использования дорогостоящих реагентов. Удачным путем решения данной проблемы может быть использование серусодержащих циклических алкинов. Мы предполагаем изучить симметричные структуры, содержащие 2 атома серы. Для этого есть несколько предпосылок: 1. Связь S-C значительно длиннее связи C-C (1.82Å и 1.54Å соответственно). 2. Окисление сульфидов позволит в существенной степени менять электронные свойства при переходе к сульфоксидам и сульфонам соответственно. 3. На основе циклических бис-сульфидов могут быть получены дикатионные структуры, с замыканием связи S-S. 4. На основе открытоцепного ацетиленового дитиола могут быть получены металлоциклы с использованием катионов тиофильных металлов. На основе доступного бутиндиола (50 Евро за 1000г) всего в 2 стадии могут быть получены соответствующие 8-10-членные сульфиды и бутиндитиол. Нужно отметить, что и соответствующий дихлорид является коммерчески доступным соединением, открывая даже одностадийный путь к циклическим ацетиленам с 2 атомами серы. Длина моста, соединяющего ацетиленовый фрагмент в этих соединениях, больше, чем у циклооктина. Ожидается, что 8-членные производные будут существенно превосходить по стабильности циклооктин, сохраняя при этом высокую реакционную способность. Атомы серы могут быть также перемещены ближе к тройной связи или удалены от нее. Также электронные свойства молекулы могут быть кардинально изменены за счет превращения сульфидов в сульфоксиды и сульфоны. Реализация данного проекта возможна лишь с привлечением квантово-механических расчётов. Полученные нами предварительные расчетные данные энергии активации для реакции SPAAC некоторых циклических алкинов с модельными азидами показывают, что теоретически некоторые серусодержащие циклоалкины могут не только приближаться по своей реакционной способности к циклооктину, но даже превосходить его. Проведённые расчёты позволят сосредоточиться на синтезе наиболее перспективных серусодержащих циклических алкинов. Мы планируем провести кинетические эксперименты при различных температурах с привлечением инструментов спектроскопии ЯМР, а также ИК-спектроскопии в режиме реального времени, так как полоса поглощения азидной группы весьма характеристична. Это позволит определить экспериментальные значения барьеров активации для реакции SPAAC с выбранными органическими азидами и провести надёжную верификацию квантовых расчётов. При этом предполагается применение как относительно доступных органических азидов, например, бензилазида и этилазидоацетата, так и более сложных соединений, содержащих азидную группу, в частности, азидоизоксазолов и азидотриазолов, синтетические подходы к которым были разработаны и опубликованы нами в последние годы [a) P.S. Lemport, I.V. Smolyar, V.N. Khrustalev, V.A. Roznyatovsky, A.V. Popov, V.A. Kobelevskaya, I.B. Rozentsveig, V.G. Nenajdenko, Org. Chem. Front., 2019, 6, pp. 335–341; b) A.V. Shastin, B.D. Tsyrenova, P.G. Sergeev, V.A. Roznyatovsky, I.V. Smolyar, V.N. Khrustalev, V.G. Nenajdenko, Org. Lett., 2018, 20 (24), pp. 7803–7806]. Отдельного внимания заслуживает и другой синтетический подход, предполагающий синтез дитиацикооктина, в котором атомы серы максимально удалены от тройной связи. Реакционная способность такого дитиациклооктина будет выше по сравнению с изомерным 1,6-дитиациклоокт-3-ином за счёт уменьшения количества C-S связей. Это соединение может быть получено исходя из ацетилена и бромэтанола. Закономерно, 9- и 10-членные циклические ацетилены, содержащие 2 атома серы, будут обладать уже намного меньшей реакционной способностью. Однако в этом случае возможно использование открытой ранее реакции образования S-S дикатионов в реакции с трифторметансульфоновым ангидридом [V.G. Nenajdenko, N.E. Shevchenko, E.S. Balenkova, I.V. Alabugin Chem. Rev. 2003, 103, 229-282; Shevchenko, N. E.; Nenajdenko, V. G.; Balenkova, E. S. Izv. AN, Ser. Khim. 2000, 1421; Nenajdenko, V. G.; Vertelezkij, P. V.; Koldobskij, A. B.; Alabugin, I. V.; Balenkova, E. S. J. Org. Chem. 1997, 62, 2483; Nenajdenko, V. G.; Shevchenko, N. E.; Balenkova, E. S. J. Org. Chem. 1998, 63, 2168]. Показано, что это превращение происходит с бис-сульфидами даже с замыканием S-S связи в 1,4-дитиане с образованием 2 четырехчленных циклов! Длина типичной связи S-S в дикатионах 2.1Å, следовательно, можно ожидать стягивания 2 атомов серы в 9-10 членных производных с замыканием 6-членного циклического ацетилена в качестве интермедиата. Нет сомнений в его крайне высокой реакционной способности, поскольку напряженность этих ацетиленов будет очень высокой (длина моста 8.6Å). Возможно, самые интересные результаты, ожидаемые в данном проекте, могут быть получены за счет разработки бинарных реакционных систем, ведущих к образованию 7-членных циклических ацетиленов. Предшественником в данном подходе планируется использовать ацетиленсодержащий дитиол, который может быть использован в реакциях с иодистым метиленом, альдегидами для получения 7-членных ацетиленов, содержащих 2 атома серы. Ожидается, что эти соединения будут иметь разумное время жизни и при этом будут обладать очень высокой реакционной способностью. Не менее перспективным представляется синтез металлоциклогептинов на основе реакции ацетиленового дитиола с галогенидами металлов. Мы предполагаем использовать хлориды различных тиофильных металлов. Ожидается, что за счет того, что связь металл-сера достаточно длинная 2.3-2.4Å, образующиеся 7-членные ацетилены будут иметь разумный баланс устойчивости и реакционной способности. Таким образом, реализация данного проекта позволит разработать новые типы циклоалкинов, которые будут обладать высокой реакционной способностью. Это позволит применять их в качестве молекулярных ловушек для короткоживующих интермедиатов, содержащих азидные группы, а также рассчитывать на их дальнейшие применения в биохимических исследованиях. При этом синтез большинства этих соединений можно будет осуществить в 2-3 стадии с высокими выходами и эффективностью. Ожидаемые в данном проекте результаты могут превзойти имеющийся уровень самых передовых достижений в данной области. По результатам выполнения проекта планируется подготовить и опубликовать не менее 4 статей в ведущих химических журналах первого и второго квартилей.
Ранее научным коллективом разработан универсальный способ получения 5-замещённых 3-азидоизоксазолов из геминальных алкенил бис-азидов на основе дихлорвинилкетонов, Ключевой стадией в данном случае является внутримолекулярная циклизация малостабильных диазидовинилкетонов, образование которых однозначно доказано авторским коллективом с применением циклооктина в качестве специфичной молекулярной ловушки. В рамках этого же направления руководителем проекта были изучены химические свойства азидоизоксазолов и показана возможность широкого круга превращений с участием азидогруппы. Результаты этой работы опубликованы в двух статьях, одна из них в журнале Organic Chemistry Frontiers (Q1), а также в виде тезисов докладов на международных и общероссийских конференциях. Также научным коллективом проведены предварительные квантово-химические расчёты, позволившие более четко сформулировать задачи в рамках настоящего проекта и выбрать наиболее перспективные объекты для направленного синтеза
грант РНФ |
# | Сроки | Название |
1 | 1 января 2022 г.-31 декабря 2022 г. | Серусодержащие циклоалкины: в поисках компромисса стабильности и реакционной способности |
Результаты этапа: В ходе выполнения 1-го этапа проекта были достигнуты следующие конкретные научные результаты: 1) разработана универсальная методика получения серусодержащих циклоалкинов из коммерчески доступного сырья. Выходы образующихся циклоалкиндисульфидов в данном случае находятся в интервале от 60 до 82%, при этом наибольший выход получен для циклоалкина с наибольшим размером цикла в этой серии. 2) Разработан эффективный подход к получению окисленных производных серосодержащих циклоалкинов. Так, в случае применения мета-хлорпербензойной кислоты (m-CPBA) удаётся получать продукты частичного окисления, в то время как использование в качестве окислителя перекиси водорода в смеси с уксусной кислотой позволяет провести полное окисление атомов серы с образованием соответствующих дисульфоновых производных. Выходы в данном случае достигают 88%. При этом сульфоновые производные выделяются из реакционной смеси простым фильтрованием. 3) Структура всех серосодержащих циклоалкинов подтверждена совокупностью спектральных методов анализа (в том числе ИК, ЯМР, масс-спектрометрия). Также удалось вырастить монокристаллы циклоалкиндисульфонов, являющихся твёрдыми и стабильными веществами, и однозначно подтвердить их строение методом рентгеноструктурного анализа. 4) Методом псевдореакций с циклогексаном нами проведена оценка напряжённости серосодержащих циклических алкинов в сравнении с циклооктином. Согласно расчёту (DFT, метод MP2/L2), по мере окисления атомов серы происходит значительное увеличение напряжения циклов. 5) Квантово-химический расчёт (метод MP2/L2) граничных орбиталей, показал, что по мере окисления атомов серы наблюдается понижение энергии ВЗМО и НСМО, причём происходит увеличение энергетической щели между орбиталями. При этом именно граничные орбитали являются реакционноспособными в реакции циклоприсоединения. Таким образом, по совокупности проведённых квантово-химических расчётов циклооктиндисульфон оказывается наиболее реакционноспособным циклическим алкином в реакциях SPAAC. 6) Результаты работы по оценке напряжённости циклических алкинов и конформационному анализу направлены в редакцию журнала «Известия академии наук – Серия химическая», статья прошла рецензирование, отзыв рецензента положительный. 7) Были выбраны три различных по природе модельных азида, а именно бензилазид, являющийся наиболее распространённым азидом для исследования реакций циклоприсоединения, этилазидоацетат, являющийся коммерчески доступным реагентом, растворимым в полярных растворителях, и азидоизоксазол, являющийся наименее активным среди трёх выбранных азидов, что делает этот реагент удобным при исследовании высокореакционноспособных циклоалкинов. Бензилазид и азидоизоксазол были синтезированы нами по известными методикам. 8) С применением методов спектроскопии ЯМР 1Н проведены кинетические эксперименты, позволившие количественно измерить барьеры активации в случае каждого из исследованных циклоалкинов. Из проведённых экспериментов следует, что дитиоциклооктиндисульфон является наиболее активной молекулой в ряду серосодержащих циклоалкинов. Таким образом, экспериментальные данные оказываются в хорошем соответствии с данными проведённых нами квантово-химических расчётов. 9) Для подтверждения возможности осуществления реакции SPAAC с использованием синтезированных нами серосодержащих циклоалкинов мы получили представительную библиотеку стабильных производных 1,2,3-триазола с выходами до 99%. Структура всех полученных соединений надёжно подтверждена совокупностью спектральных методов исследования. В случае одного из продуктов был выращен монокристалл, пригодный для исследования его структуры методом рентгеноструктурного анализа. 10) По результатам выполнения 1-го этапа работы можно сделать вывод о том, циклооктиндисульфон является перспективным циклоалкином для реакции SPAAC, поскольку он способен реагировать с органическими азидами при температурах не выше 40С, является стабильным соединением при нормальных условиях (т. разл. ~ 250C), может быть получен из коммерчески доступного сырья, а также принципиально возможно применение этого серосодержащего циклоалкина для реакций с азидами в водных средах. 11) Результаты работы по проекту были представлены в виде устного доклада на Всероссийской научной конференции "Марковниковские чтения: органическая химия от Макровникова до наших дней" (WSOC 2022, Лоо, Сочи, 16-21 сентября 2022). 12) В ходе выполнения 1-го этапа работы была подготовлена и принята к печати редакцией журнала «Успехи химии» (квартиль Q1) обзорная статья по способам синтеза, химических свойствам и аспектам практического применения ди- и поли-азидов. | ||
2 | 1 января 2023 г.-31 декабря 2023 г. | Серусодержащие циклоалкины: в поисках компромисса стабильности и реакционной способности |
Результаты этапа: 1) В соответствии с планом работ проведена оптимизация условий синтеза циклооктиндисульфона, показавшего в ходе выполнения первого этапа работы наибольшую реакционную способность, стабильность и синтетическую доступность. Проведённые эксперименты позволили усовершенствовать методику синтеза циклоокт-3-ин-1,6-дисульфона (схема 1). Общий выход в расчёте на две стадии в данном случае составляет 60%, что является достаточно высоким для синтеза соединений этого класса. Схема 1. “One-pot” метод получения циклооктиндисульфона 4 Усовершенствование методики заключается в исключении стадии выделения в индивидуальном виде циклооктиндисульфида 3, продукта реакции циклизации 1,4-дибромбутина 1 с этан-1,2-дитиолом 2, которая осуществляется в присутствии карбоната цезия в среде абсолютного ацетонитрила. По завершению реакции смесь фильтруют и отгоняют растворитель в вакууме водоструйного насоса, после чего продукт из образовавшегося сухого остатка экстрагируют ледяной уксусной кислотой и добавляют перекись водорода, выступающую в роли окислителя атомов серы циклооктиндисульфида 3. В результате реакции окисления выпадает белый осадок, который представляет собой целевой циклооктиндисульфон 4. 2) В соответствии с усовершенствованной методикой, разработанной в ходе выполнения п.1, циклооктиндисульфон был наработан в количестве более 1 грамма, что позволило существенно расширить круг химических трансформаций с применением этого напряжённого циклоалкина и провести дополнительные эксперименты, направленные на оценку его реакционной способности в реакциях SPAAC c органическими азидами различного строения. 3) Были проведены квантово-химические расчёты с целью сравнения реакционной способности циклооктиндисульфона и других напряженных циклических алкинов, в том числе серосодержащих, в реакции c бензилазидом (схема 2). Расчёты проводились в газовой фазе. Схема 2. Реакция SPAAC бензилазида с напряжёнными циклическими алкинами На рисунке 1 приведены значения энергии активации (ккал/моль) для циклооктиндисульфона и некоторых других циклических алкинов. Рисунок 1. Еакт (ккал/моль) для реакции бензилазида с циклоалкинами Из приведённого рисунка видно, что в ряду циклоалкиндисульфонов барьер активации рассматриваемой реакции снижается с уменьшением размера цикла, причём снижение Eакт при переходе от 9-ти к 8-ми членному ожидаемо более резкое, чем при сравнении 10-ти и 9-ти членных циклов соответственно. Значение энергии активации для циклооктиндсульфона (на рисунке выделен синим цветом) позволяет говорить о том, что его реакционная способность в реакции с бензилазидом сопоставима с наиболее реакционноспособными циклоалкинами в рассматриваемом ряду, однако синтез циклооктиндисульфона осуществляется в намного меньшее число стадий и с приемлемым выходом, что наряду с его высокой стабильностью делает этот напряжённый циклический алкин весьма перспективным реагентом для реакции SPAAC. На рисунке 2 приведены значения энергии активации для реакции циклооктиндисульфона с органическими азидами различного строения, в том числе с водорастворимыми азидокарбоновыми кислотами. Рисунок 2. Еакт (ккал/моль) для реакции циклооктиндисульфона с азидами Квантово-химические расчеты проводились с использованием гибридного функционала Бекке (B3) для электронного обмена и корреляционного функционала Ли, Янга и Парра (LYP), реализованного в пакете программ GAUSSIAN 09. Все атомы моделировались на уровне теории 6-311G++(d,p). Начальные геометрии для поиска переходного состояния находились либо с помощью процедур QST2 или QST3. Переходные состояния были оптимизированы как седловые точки первого порядка с использованием алгоритма Берни. Были проведены частотные расчеты, чтобы подтвердить природу стационарных точек, что дало одну мнимую частоту для всех переходных состояний, которая представляла собой вектор образования связи С-N. Влияние растворителя учитывали путем проведения оптимизаций в силовом поле SMD. С целью подтверждения данных, полученных с помощью квантово-химических расчётов, на примере реакции циклооктиндисульфона с азидоуксусной кислотой (схема 3) с применением спектроскопии 1Н ЯМР были проведены кинетические эксперименты при трёх разных температурах (40, 50 и 60С) и экспериментально определён барьер активации для данного превращения, который составил 15.4 ккал/моль, что находится в хорошем соответствии с данными теоретических расчётов (16.6 ккал/моль). Схема 3. Реакция SPAAC циклооктиндисульфона с азидоуксусной кислотой На рисунке 3 приведены кинетические кривые и линеаризация зависимости логарифма констант скоростей реакций. Рисунок 3. Кинетические кривые при различных температурах (слева) и линеаризация зависимости логарифма констант скорости реакции от 1/T (справа) Из рисунка 3 видно, что значения логарифмов констант после линеаризации находятся на одной прямой линии, что говорит о надёжности полученных данных. Также по результатам проведённых кинетических экспериментов можно сделать вывод о том, что реакция циклооктиндисульфона с азидокарбоновыми кислотами может быть проведена в биоортогональных условиях, то есть при температурах не выше 40С. 4) В соответствии с планом работ был осуществлён синтез широкого круга водорастворимых азидов для исследования реакции SPAAC с циклооктиндисульфоном в биоортогональных условиях (в водных средах при температурах не менее 40С). При этом в качестве объектов исследования были выбраны азидные производные карбоновых и дикарбоновых кислот. Такие соединения могут быть получены реакцией прямого азидирования из соответствующих аминопроизводных. Для осуществления этой реакции исходя из хлористого сульфурила, азида натрия и 1,3-имидазола нами был получен 1H-имидазол-1-сульфонилазид гидрохлорид, который в соответствии с литературными данными является эффективным агентом прямого азидирования аминокислот и их сложноэфирных производных. С использованием этого азидирующего агента нами был получен широкий круг потенциально водорастворимых производных азидокарбоновых кислот (Схема 4). Схема 4. Синтез азидирующего агента и производных азидокарбоновых кислот Стоит заметить, что сложноэфирные производные азидокарбоновых кислот могут быть легко превращены в соответствующие азидокарбоновые кислоты с выходами, близкими к количественным. 5) Производные азидокарбоновых кислот были введены в реакцию SPAAC с циклооктиндисульфоном, в результате чего были получены соответствующие устойчивые производные 1,2,3-триазола (рисунок 4), их строение и индивидуальность состава были подтверждены различными спектральными методами, в том числе спектроскопией ЯМР на ядрах 1Н и 13С, ИК-спектроскопией и масс-спектрометрией. При этом выходы триазолов оказываются очень высокими либо близкими к количественным. Рисунок 4. Расширение библиотеки производных 1,2,3-триазола Таким образом, расширена библиотека 1,2,3-триазолов на основе функционализированных органических азидов и циклооктиндисульфона. Данные соединения содержат различные функциональные группы, что создает возможности для осуществления последующих химических трансформаций этих соединений. 6) Ряд функционализированных азидов был введен в реакцию с циклооктиндисульфоном в условиях близких к биоортогональным, то есть в водной среде при температуре ~37oC. В данных условиях реакция завершается за время от 36 до 48 часов в зависимости от строения исходного азида (рисунок 5). Рисунок 5. Время достижения полной конверсии азидокарбоновых кислот Образующиеся производные 1,2,3-триазола либо выпадают из реакционной массы и могут легко выделены фильтрованием либо оказываются водорастворимыми соединениями. В последнем случае удаётся зарегистрировать ЯМР-спектры в среде D2O. Полученные результаты подтверждают возможность использования циклооктиндисульфона для реакции SPAAC с азидами в биоортогональных условиях. 7) В рамках запланированных работ исследована возможность осуществления “one-pot”-синтеза производных 1,2,3-триазола с применением реакции SPAAC исходя из циклооктиндисульфона и соответствующих аминокислот без предварительного выделения азидокарбоновых кислот в виде индивидуальных соединений, однако в данном случае разработка эффективного способа успехом не увенчалась. Одной из вероятных причин является возможность реакции SPAAC между агентом азидирования аминокислот и напряжённым циклическим алкином. 8) В соответствии с заявленными планом сформированы рекомендации по дальнейшим возможным направлениям развития данной научной тематики: • реакция циклооктиндисульфона с другими 1,3-диполями помимо азидогруппы, например, азометинилидами, азометиниминами, нитронами и другими; • азидофункционализация природных высокомолекулярных соединений, в частности, хитозана и бычьего сывороточного альбумина, и последующая реакция азидосодержащих полимеров с напряжёнными циклическими алкинами; • применение циклооктиндисульфона в качестве реагента для получения водорастворимых лигандов для экстракционного разделения f-элементов при переработке отработавшего ядерного топлива; • использование циклооктиндисульфона в качестве реагента для реакции с геминальными диазидами, в том числе серосодержащими производными. В рамках предварительной проверки сформированных предложений был разработан принципиально новый синтетический подход к 4,7-диазидо-1,10-фенантролин-2,9-диамидам (схема 5), которые являются подходящими субстратами для реакции с напряжёнными циклическими алкинами, в частности, с циклооктиндисульфоном 4. Схема 5. Синтез диазидофенантролина 13 и реакция SPAAC с циклоалкинами Единовременное наличие в одной органической молекуле двух и более азидных групп открывает новые возможности для создания высокофункционализированных соединений. Особенного внимания заслуживают геминальные диазиды, соединения, в которых две азидные группы связаны с одним и тем же атомом углерода. Такие диазиды ожидаемо являются высокореакционными соединениями и открывают доступ к широкому кругу всевозможных гетероциклов. Наличие атомов серы, и в особенности, сульфоновой группы, позволяет рассчитывать на появление новых ценных свойств у образующихся функционализированных органических молекул, например, водорастворимости и/или биологической активности. В рамках расширения доступных альтернатив по развитию направления мы синтезировали первые примеры 1,1-диазидовинилсульфонов и показали, что эти соединения вступают в реакцию SPAAC с напряжёнными циклическими алкинами, приводя к образованию соответствующих сульфонсодержащих бис-триазолов с высокими выходами (схема 6). Схема 6. Синтез 1,1-диазидовинилсульфонов и реакция SPAAC с их участием Реакция 1,1-диазидовинилсульфонов с циклооктиндисульфоном должна приводить к водорастворимым триазольным производным. 9) Результаты работы по проекту представлены на Международной научной конференция студентов, аспирантов и молодых учёных «Ломоносов-2023» (Докладчик Р.В. Зонов). 10) Результаты работы опубликованы в журнале Mendeleev Communications. |
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".
№ | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
---|---|---|---|---|---|
1. | Статья в "Известия АН - Серия Химическая" | IzvAN_Tsikloalkinyi_06_12_2022.pdf | 1013,2 КБ | 21 декабря 2022 [lemport] |