ИСТИНА

Кондакова Ольга Анатольевна пользователь ответственный

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр, 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования, старший научный сотрудник, с 15 марта 2005

кандидат химических наук с 1999 года

Прежние места работы (Нажмите для отображения)

МГУ имени М.В. Ломоносова, Научно-исследовательский вычислительный центр, 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования, ответственный по системе

Соавторы: Сулимов В.Б., Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Романов А.Н., Зюбин А.С., Тихонравов А.В., Кочиков И.В., Dembovskii S.A., Каткова Е.В., Лущекина С.В., Соболев С.И., Атауллаханов Ф.И., Кутов Д.К. показать полностью..., Головачева А.Ю., Жабин С.Н., Синауридзе Е.И., Брызгалов П.А., Кузнецов Ю.В., Офёркин И.В., Bogolyubov A.A., Golovacheva A.Y., Irigoras A., Sicilia E., Sinauridze E., Smolov M., Ugalde J.M., Амочкина Т.В., Базилевский М.В., Бутылин А.А., Воеводин В.В., Головин А.В., Готтих М.Б., Дереза Т.Л., Дутов М.Д., Лайков Д.Н., Масленников Е.Д., Медведев О.С., Медведева Н.А., Тайдаков И.В., Чернобровкин А.Л.

43 статьи, 9 докладов на конференциях, 6 тезисов докладов, 17 НИР, 2 свидетельства о регистрации прав на ПО, 1 членство в программном комитете, 1 дипломная работа

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 379, Scopus: 382

IstinaResearcherID (IRID): 437183

ResearcherID: H-7930-2017

Деятельность

---

• Статьи в журналах

  • 
    • 2017 Computational experiments on atomistic modeling of thin-film deposition
    • Grigoriev F., Sulimov A., Kochikov I., Kondakova O., Sulimov V., Tikhonravov A.
    • в журнале Applied optics, издательство Optical Society of America (United States), том 56, № 4, с. c87-c90 DOI
  • 
    • 2017 Influence of the Method of Hydrogen Atoms Incorporation into the Target Protein on the Protein-Ligand Binding Energy
    • Kutov D.C., Katkova E.V., Sulimov A.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B.
    • в журнале Вестник Южно-Уральского государственного университета. Серия Математическое моделирование и программирование, том 10, № 3, с. 94-107 DOI
  • 
    • 2017 ПОИСК ПОДХОДОВ К УЛУЧШЕНИЮ ТОЧНОСТИ РАСЧЕТОВ ЭНЕРГИИ СВЯЗЫВАНИЯ БЕЛОК-ЛИГАНД С ПОМОЩЬЮ ДОКИНГА
    • СУЛИМОВ А.В., КУТОВ Д.К., КАТКОВА Е.В., КОНДАКОВА О.А., СУЛИМОВ В.Б.
    • в журнале Известия Академии наук. Серия химическая, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), № 10, с. 1913-1924 DOI
  • 
    • 2016 Full-atomistic nanoscale modeling of the ion beam sputtering deposition of SiO2 thin films
    • Grigoriev F.V., Sulimov A.V., Katkova E.V., Kochikov I.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в журнале Journal of Non-Crystalline Solids, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 448, с. 1-5 DOI
  • 
    • 2015 High-performance atomistic modeling of optical thin films deposited by energetic processes
    • Grigoriev F.V., Sulimov A.V., Kochikov I.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в журнале International Journal of High Performance Computing Applications, издательство SAGE Publications (United States), том 29, № 2, с. 184-192 DOI
  • 
    • 2015 Суперкомпьютерное исследование низкоэнергетических минимумов энергии системы белок-лиганд
    • Оферкин И.В., Сулимов А.В., Каткова Е.В., Кутов Д.К., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Биомедицинская химия, том 61, № 6, с. 712-716 DOI
  • • 2013 Алгоритм суперкомпьютерного моделирования напыления оптических нанопокрытий
    • Григорьев Ф.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 14, с. 323-327
  • 
    • 2013 Пространственные и временные эффекты при осаждении частиц на тонкие пленки диоксида кремния, получаемые с использованием высокоэнергетических процессов напыления
    • Григорьев Ф.В., Сулимов В.Б., Кондакова О.А., Кочиков И.В., Тихонравов А.В.
    • в журнале Вестник Московского университета. Серия 3: Физика, астрономия, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), № 3, с. 80-83 DOI
  • 
    • 2012 Stability of HIV-1 integrase–ligand complexes: the role of coordinating bonds
    • Grigoriev F.V., Golovacheva A.Yu, Romanov A.N., Kondakova O.A., Sulimov A.V., Smolov M.A., Gottikh M.B., Sulimov V.B., Bogolyubov A.A., Kuznetsov Yu V., Dutov M.D.
    • в журнале Structural Chemistry, издательство Springer-Verlag (Heidelberg, Germany), том 23, № 1, с. 185-195 DOI
  • • 2012 Квантово-химическая оценка фторкислотности как метод определения условий стабилизации субвалентных форм висмута во фторидных стеклах
    • Кондакова О.А., Романов А.Н., Масленников Е.Д., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 13, с. 347-351
  • • 2012 Суперкомпьютерное моделирование современных процессов напыления оптических нанопокрытий
    • Тихонравов А.В., Кочиков И.В., Амочкина Т.В., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 13, с. 490-496
  • 
    • 2011 New Synthetic Thrombin Inhibitors: Molecular Design and Experimental Verification
    • Sinauridze E., Romanov A., Gribkova I., Kondakova O., Surov S., Gorbatenko A., Butylin A., Monakov M., Bogolyubov A., Kuznetsov Yu, Sulimov V., Ataullakhanov F.
    • в журнале PLoS ONE, издательство Public Library of Science (United States), том 6, № 5, с. e19969 DOI
  • • 2011 Квантово-химическое моделирование возбужденных состояний монокатиона висмута
    • Романов А.Н., Кондакова О.А., Головачева А.Ю., Сулимов А.В., Оферкин И.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 417-422
  • • 2011 Новые прямые низкомолекулярные синтетические ингибиторы тромбина
    • Синауридзе Е.И., Романов А.Н., Кондакова О.А., Грибкова И.В., Суров С.С., Горбатенко А.С., Кузнецов Ю.В., Боголюбов А.А., Сулимов В.Б., Атауллаханов Ф.И.
    • в журнале Технологии живых систем, издательство Издательство "Радиотехника" (Москва), том 8, № 3, с. 34-47
  • • 2011 Расчет параметров возбужденных состояний поликатиона Bi53+ методом спин-орбитального конфигурационного взаимодействия
    • Романов А.Н., Кондакова О.А., Втюрина Д.Н., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 443-449
  • • 2011 Реализация поддержки параллельных вычислений в программах докинга SOLGRID и SOL
    • Оферкин И.В., Сулимов А.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 12, с. 9-23
  • 
    • 2009 The Thermodynamic Characteristics of Formation of Organic Molecule Complexes with the Magnesium Ion in Water: The Results of Quantum-Chemical Modeling
    • Grigoriev F.V., Golovacheva A.Yu, Romanov A.N., Kondakova O.A., Sulimov V.B.
    • в журнале Russian Journal of Physical Chemistry A, издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 83, № 4, с. 565-574 DOI
  • • 2008 Гиперкоагуляция, вызываемая разбавлением плазмы искусственными плазмозамещающими растворами
    • Синауридзе Е.И., Горбатенко А.С., Грибкова И.В., Сулимов В.Б., Романова А.Н., Кондакова О.А., Ажигирова М.А., Дереза Т.Л., Кузнецов Ю.В., Боголюбов А.А., Атауллаханов Ф.И.
    • в журнале Технологии живых систем, издательство Издательство "Радиотехника" (Москва), № 1, с. 3-14
  • • 2008 Компьютерный дизайн лекарственных средств: программа докинга SOL
    • Романов А.Н., Кондакова О.А., Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Лущекина С.В., Мартынов Я.Б., Сулимов В.Б.
    • в журнале Вычислительные методы и программирование, издательство Научно-исследовательский вычислительный центр Московского государственного университета им. М.В. Ломоносова (Москва), том 9, с. 213-233
  • 
    • 2006 Computation of hydration free energies of organic solutes with an implicit water model
    • Basilevsky M.V., Leontyev I.V., Luschekina S.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B.
    • в журнале Journal of Computational Chemistry, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 27, № 5, с. 552-570 DOI
  • 
    • 2006 Mixed implicit/explicit solvation models in quantum mechanical calculations of binding enthalpy for protein-ligand complexes
    • Nikitina E., Sulimov V., Grigoriev F., Kondakova O., Luschekina S.
    • в журнале International Journal of Quantum Chemistry, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 106, № 8, с. 1943-1963 DOI
  • 
    • 2004 Theoretical study of two-state reactivity of transition metal cations: The "difficult" case of iron ion interacting with water, ammonia, and methane
    • Chiodo S., Kondakova O., Michelini M.D., Russo N., Sicilia E., Irigoras A., Ugalde J.M.
    • в журнале The Journal of Physical Chemistry A: Molecules, Clusters, and Aerosols, издательство American Chemical Society (United States), том 108, № 6, с. 1069-1081 DOI
  • 
    • 2003 Quantum chemical modeling of the structure and ion location in chlorine-doped alkali-borate glasses
    • Kondakova O.A., Zyubin A.S., Dembovsky S.A.
    • в журнале Solid State Ionics, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 157, № 1-4, с. 305-311 DOI
  • 
    • 2003 Quantum-chemical modeling of impurity defects involving chlorine in amorphous selenium
    • Zyubin A.S., Kondakova O.V., Dembovskii S.A.
    • в журнале Russian Journal of Inorganic Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 48, № 7, с. 1045-1052
  • 
    • 2003 Quantum-chemical study of the structure and properties of defects involving germanium in amorphous selenium
    • Zyubin A.S., Kondakova O.V.
    • в журнале Russian Journal of Inorganic Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 48, № 8, с. 1225-1229
  • 
    • 2003 Reaction of bare VO+ and FeO+ with ammonia: A theoretical point of view
    • Chiodo S., Kondakova O., Michelini M.D., Russo N., Sicilia E.
    • в журнале Inorganic Chemistry, издательство American Chemical Society (United States), том 42, № 26, с. 8773-8782 DOI
  • 
    • 2001 Quantum chemical modeling of chlorine-doped defects in a-Se
    • Zyubin A.S., Kondakova O.A., Dembovsky S.A.
    • в журнале Physica B: Condensed Matter, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 308, с. 1061-1064 DOI
  • 
    • 2001 Quantum-chemical modeling of chlorine-doped and hypervalent defects participation in reconstruction of the a-Se structure
    • Kondakova O.A., Zyubin A.S., Dembovsky S.A., Kurnakov N.S.
    • в журнале Journal of Optoelectronics and Advanced Materials, издательство National Institute of Research and Development for Optoelectronics (Romania), том 3, № 4, с. 847-853
  • 
    • 2000 A quantum-chemical study of the mechanism of ionic conductivity in alkali borate glasses
    • Kondakova O.A., Zyubin A.S., Dembovsky S.A.
    • в журнале Glass Physics and Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 26, № 5, с. 418-424
  • 
    • 1999 Mobility of alkali metal ions in alkali-borate glasses: A quantum-chemical study
    • Zyubin A.S., Kondakova O.A., Dembovskii S.A.
    • в журнале Russian Journal of Electrochemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 35, № 9, с. 973-985
  • 
    • 1999 Quantum-Chemical Study of Properties of the Continuous Disordered Network in ZnCl(2) Glasses
    • Zyubin A.S., Kondakova O.A., Dembovskii S.A.
    • в журнале Russian Journal of Inorganic Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 44, № 6, с. 915-921
  • 
    • 1999 Quantum-chemical simulation of the incorporation of a Li2O molecule into vitreous B2O3 and SiO2
    • Kondakova O.A., Dembovsky S.A., Zyubin A.S.
    • в журнале Glass Physics and Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 25, № 5, с. 441-448
  • 
    • 1999 Quantum-chemical simulation of the vibrational spectra of structural fragments in vitreous SiO2 and GeO2
    • Zyubin A.S., Dembovsky S.A., Kondakova O.A.
    • в журнале Glass Physics and Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 25, № 4, с. 328-334
  • 
    • 1998 Quantum chemical study of the network modification in vitreous B2O3
    • Zyubin A.S., Dembovsky S.A., Kondakova O.A.
    • в журнале Journal of Non-Crystalline Solids, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 224, № 3, с. 291-298 DOI
  • 
    • 1998 Quantum-chemical modeling of decomposition of continuous disordered network in glassy BeF2
    • Zyubin A.S., Kondakova O.A., Dembovskii S.A.
    • в журнале ZHURNAL NEORGANICHESKOI KHIMII, том 43, № 6, с. 1025-1030
  • 
    • 1997 Quantum-chemical simulation of the transformations of continuous random network in the vitreous GeO2
    • Zyubin A.S., Kondakova O.A., Dembovsky S.A.
    • в журнале Glass Physics and Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 23, № 1, с. 58-66
  • 
    • 1996 Quantum-chemical study of the destruction of the infinite random network in vitreous B2O3
    • Zyubin A.S., Dembovskii S.A., Kondakova O.A.
    • в журнале ZHURNAL NEORGANICHESKOI KHIMII, том 41, № 5, с. 804-812

• Статьи в сборниках

  • • 2016 Prospects of High-Performance Computational Experiments on Thin Film Growth
    • Grigoriev F., Sulimov A., Kochikov I., Kondakova O., Sulimov V., Tikhonravov A.
    • в сборнике Optical Interference Coatings 2016, OSA Technical Digest (online) (Optical Society of America, 2016), место издания OSA Publishing USA, с. WB.5-WB.5 DOI
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование механических напряжений в тонких пленках
    • Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в сборнике Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (26-27 сентября 2016 г., г. Москва), место издания Изд-во МГУ М, с. 683-688
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование напыления тонких пленок
    • Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кочиков И.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в сборнике Суперкомпьютерные технологии (СКТ-2016) (19-24 сентября 2016 г.) Материалы 4-й Всероссийской научно-технической конференции: в 2-х томах, место издания Издательство ЮФУ Ростов-на-Дону, том 2, с. 223-227
  • 
    • 2015 Supercomputer modeling of the ion beam sputtering process: full-atomistic level
    • Grigoriev F.V., Sulimov A.V., Kochikov I.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Tikhonravov A.V.
    • в сборнике Optical Systems Design: Advances in Optical Thin Films V, серия PROCEEDINGS OF SPIE - THE INTERNATIONAL SOCIETY FOR OPTICAL ENGINEERING, издательство SPIE, the International Society for Optical Engineering (Bellingham, WA, United States), том 9627, с. 962708-1-962708-9 DOI
  • • 2011 Применение методов молекулярного моделирования для разработки новых ингибиторов эндотелин-превращающего фермента
    • Кондакова О.А., Головачева А.Ю., Романов А.Н., Лайков Д.Н., Медведева Н.А., Медведев О.С., Головин А.В., Сулимов В.Б.
    • в сборнике В монографии «Постгеномные исследования и технологии» под ред. член-корр. РАН С.Д.Варфоломеева, место издания МАКС Пресс Москва, с. 141-173
  • • 2006 Веб-ориентированная система молекулярного моделирования Keenbase для разработки новых лекарств
    • Сулимов В.Б., Романов А.Н., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов А.В., Жабин С.Н., Соболев С.И.
    • в сборнике Труды Всероссийской научной конференции "Научный сервис в сети Интернет: Технологии параллельного программирования" (г. Новороссийск, 18-23 сентября 2006 г.), место издания МГУ Москва, с. 18-23

• Доклады на конференциях

  • • 2017 Молекулярно-динамическое моделирование напыления тонких оптических покрытий (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Тихонравов А.В., Сулимов В.Б., Кондакова О.А.
    • ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ АТОМИСТИЧЕСКОГО МНОГОМАСШТАБНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ, Новый Афон, Абхазия, Республика Абхазия, 16-27 августа 2017
  • • 2016 Quantum-chemical approach and the role of solvent (Устный)
    • Авторы: Katkova E.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B., Kutov D.C., Sulimov A.V.
    • XX Менделеевский съезд по общей и прикладной химии, Екатеринбург, Россия, 26 сентября - 1 октября 2016
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование механических напряжений в тонких пленках (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Кондакова О.А., Кочиков И.В.
    • Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2016", Москва, Россия, 26-27 сентября 2016
  • • 2016 Суперкомпьютерное моделирование напыления тонких пленок (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Тихонравов А.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Кочиков И.В.
    • 4-я Всероссийская научно-техническая конференция "Суперкомпьютерные технологии", Геленджик, Россия, 19-24 сентября 2016
  • • 2016 Prospects of High-Performance Computational Experiments on Thin Film Growth (Устный)
    • Авторы: Grigoriev F., Sulimov A., Tikhonravov A., Kondakova O., Sulimov V., Kochikov I.
    • Optical Interference Coatings 2016, Loews Ventana Canyon, Tucson, Arizona, США, 19-24 июня 2016
  • • 2015 Supercomputer modeling of the ion beam sputtering process: full-atomistic level (Устный)
    • Авторы: Grigoriev Fedor V., Sulimov Alexei V., Kochikov Igor V., Kondakova Olga A., Sulimov Vladimir B., Tikhonravov Alexander V.
    • SPIE Optical System Design, Йена (Jena), Германия, 7-10 сентября 2015
  • • 2015 Суперкомпьютерное моделирование процессов роста оптических покрытий (Устный)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В., Кондакова О.А., Кочиков И.В.
    • Ломоносовские чтения - 2015, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 21-23 апреля 2015
  • • 2010 Персонифицированная медицина - предсказания событий на основе байесовской сети доверия: алгоритм и программная реализация (Устный)
    • Авторы: Масленников Е.Д., Романов А.Н., Втюрина Д.Н., Кондакова О.А., Курочкин И.Н., Упоров И.В., Сулимов А.В., Сулимов В.Б.
    • Ломоносовские чтения - 2010, МГУ имени М.В. Ломоносова, Россия, 20-21 апреля 2010
  • • 2009 A new method to estimate stability of chelate complexes and its application for HIV-1 integrase inhibitor design (Устный)
    • Авторы: Golovacheva A.Y., Григорьев Ф.В., Романов А.Н., Сулимов В.Б., Smolov M., Готтих М.Б., Кондакова О.А.
    • Fith International Symposium on Computational Methods in Toxicology and Pharmacology Integrating Internet Resources, Istanbul, Turkey, Турция, 2009

• Тезисы докладов

  • • 2017 МОЛЕКУЛЯРНО-ДИНАМИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ НАПЫЛЕНИЯ ТОНКИХ ОПТИЧЕСКИХ ПОКРЫТИЙ
    • Григорьев Ф.В., Сулимов А.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • в сборнике Тезисы докладов 14-ой Российской Школы-Симпозиума ФУНДАМЕНТАЛЬНЫЕ ОСНОВЫ АТОМИСТИЧЕСКОГО МНОГОМАСШТАБНОГО МОДЕЛИРОВАНИЯ (ФОАММ-2017), серия Симпозиум АТОМИСТИЧЕСКОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ, место издания г. Долгопрудный, тезисы, с. 1-21
  • • 2016 Docking accuracy: quantum-chemical approach and the role of solvent
    • Kutov D.C., Sulimov A.V., Katkova E.V., Kondakova O.A., Sulimov V.B.
    • в сборнике ХХ Менделеевский съезд по общей и прикладной химии. Екатеринбург, 26-30 сентября 2016 г. Тезисы докладов в пяти томах, место издания УрО РАН Екатеринбург, том 5, тезисы, с. 108-108
  • • 2007 New Thrombin Inhibitors: Molecular Design and Experimental Discovery
    • Sulimov V.B., Romanov A.N., Kondakova O.A., Sinauridze E.I., Butylin A.A., Gribkova I.V., Gorbatenko A.S., Bogoliubov A.A., Titov I.Yu, Polunin E.V., Kuznetsov Yu V., Taidakov I.V., Voevodin V.V., Sobolev S.I., Ataullakhanov F.I.
    • в сборнике IDDST-2007 (International Drug Discovery Science & Technology), 7-13 November 2007, Xi'an, China, место издания Xi'an, China, тезисы, с. 145-145
  • • 2006 Web-oriented system Keenbase for virtual screening and design of new ligands for biological macromolecules. Application for new drugs searches
    • Sulimov V., Romanov A., Grigoriev F., Kondakova O., Sulimov A., Bryzgalov P., Zhabin S., Chernobrovkin A., Sobolev S.
    • в сборнике Book of abstract Saint-Petersburg international workshop on nanobiotechnologies, тезисы, с. 27-29
  • • 2006 Веб-ориентированная система Keenbase для виртуального поиска ингибиторов для заданных макромолекул-мишеней и конструирования новых лекарственных средств
    • Сулимов В.Б., Романов А.Н., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов А.В., Брызгалов П.А., Жабин С.Н., Чернобровкин А.Л., Лущекина С.В., Соболев С.И.
    • в сборнике 3-я Международная научно-практическая конференция «Новые технологии создания инновационных лекарств. От достижений «постгеномной эры» к национальным фармацевтическимя брендам. Центр высоких технологий «Химрар», 1 декабря 2006 г, тезисы
  • • 2006 Оценка энергии связывания белок-лиганд с учетом растворителя и программа докинга SOL: принцип работы и характеристики
    • Сулимов В.Б., Романов А.Н., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Лущекина С.В., Соболев С.И.
    • в сборнике Сборник материалов XIII российского национального конгресса "Человек и лекарство", 3 апреля 2006 г, тезисы, с. 37-37

• НИРы

  • • 3 апреля 2023 - 9 ноября 2025 Разработка программного средства моделирования электромагнитных процессов в сложных технических объектах с использованием интегро-дифференциальных уравнений во временной области
    • Научно-исследовательский вычислительный центр
    • Руководитель: Сетуха А.В. Ответственный исполнитель: Кондакова О.А. Участники НИР: Лубянский В.И., Масс И.А., Поворознюк А.П., Сетуха Е.А., Тыртышников Е.Е.
  • • 18 июля 2022 - 9 ноября 2022 Разработка предложений по созданию и развитию вычислительных методов эксафлопсного уровня для моделирования электродинамических процессов в частотной области, переноса и преобразования примесей в атмосферных слоях
    • 4.11.Лаборатория вычислительных методов
    • Руководитель: Сетуха А.В. Участники НИР: Варенцов А.И., Дебольский А.В., Кондакова О.А., Мортиков Е.В., Степаненко В.М., Суязова В.И., Ткаченко Е.В., Тыртышников Е.Е.
  • • 6 июля 2021 - 30 октября 2021 Проведение исследований, направленных на повышение лучевой прочности многослойных оптических покрытий при воздействии мощного импульсного лазерного излучения
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Ответственные исполнители: Григорьев Ф.В., Сулимов В.Б. Участники НИР: Кондакова О.А., Починок И.В., Серов В.А., Смирнова Е.Н., Сулимов А.В., Шарапова С.А.
  • • 1 января 2021 - 31 декабря 2025 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физических, физико-химических, биофизических и медицинских проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Ильин И.С., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Сулимов А.В., Тащилова А.С.
  • • 23 апреля 2019 - 31 декабря 2021 Суперкомпьютерное моделирование свойств материалов тонких пленок для оптических и лазерных технологий
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Ответственные исполнители: Григорьев Ф.В., Кутов Д.К., Сулимов А.В., Сулимов В.Б. Участники НИР: Ильин И.С., Исаев Т.Ф., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Лагутин Ю.С., Лагутина А.А., Савкин И.А., Смирнова Е.Н., Тащилова А.С., Шарапова С.А.
  • • 28 августа 2017 - 31 декабря 2018 Качественное расширение возможностей Центра коллективного пользования сверхвысокопроизводительными вычислительными ресурсами Московского университета по решению новых классов задач и метрологическому обеспечению работы суперкомпьютерного комплекса
    • Ректорат
    • Руководитель: Садовничий В.А. Ответственные исполнители: Воеводин В.В., Тихонравов А.В. Участники НИР: Антонов А.С., Антонова А.П., Афанасьев И.В., Гамаюнова Т.С., Гуляев А.В., Донгарра Д.Д., Желтков А.А., Жуков К.А., Жуматий С.А., Кондакова О.А., Леоненков С.Н., Лукашенко Т.П., Никитенко Д.А., Попова Н.Н., Руденко Н.М., Сидоров И.Ю., Федянин А.А., Швец П.А., Шкаликов А.А., Шоков В.Н.
  • • 4 мая 2017 - 31 декабря 2018 Высокопроизводительные технологии моделирования релаксационных процессов в наноструктурированных тонких пленках
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Ответственные исполнители: Григорьев Ф.В., Кочиков И.В., Шарапова С.А. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Ильин И.С., Ильин И.С., Исаев Т.Ф., Кондакова О.А., Лагутина А.А., Лукьяненко Д.В., Смирнова Е.Н., Смирнова М.А., Смирнова М.А., Смирнова М., Сулимов В.Б.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физических, физико-химических, биофизических и медицинских проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Ильин И.С., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Савкин И.А., Сулимов А.В., Тащилова А.С.
  • • 1 января 2016 - 31 декабря 2020 Создание комплекса инструментальных средств для автоматизации процессов разработки и оптимизации параллельных программ
    • 4.08.Лаборатория параллельных информационных технологий
    • Руководитель: Воеводин В.В. Участники НИР: Антонов А.С., Антонова А.П., Афанасьев И.В., Афанасьева Е.Ю., Баруздин Н.Э., Воеводин В.В., Волков Н.И., Гамаюнова Т.С., Донгарра Д.Д., Енокян К.Э., Желтков А.А., Жуматий С.А., Кондакова О.А., Коньшин И.Н., Куркин К.В., Леоненков С.Н., Никитенко Д.А., Паокин А.В., Потапов Ю.Ю., Рощина О.П., Сидоров И.Ю., Соболев С.И., Стефанов К.С., Тарумова Н.Т., Теплов А.М., Хабирова Э.Р., Чернявский А.Ю., Шайхисламов Д.И., Швец П.А.
  • • 1 января 2015 - 31 декабря 2018 Научные основы создания Национального банка-депозитария живых систем
    • Ректорат
    • Руководитель: Садовничий В.А. Ответственный исполнитель: Каменский П.А. Участники НИР: Cоина В.С., Абрамов С.М., Аверина О.А., Агеева Л.В., Адельянов А.М., Азовский А.И., Акопян Ж.А., Аксенова А.А., Аксенова В.А., Аксянов Е.А., Аласания К.Ю., Александров В.В., Александрова А.В., Александрушкина Н.И., Александрушкина Н.А., Алексеевский А.В., Аляутдинов А.Р., Алёшин В.В., Андреева Т.В., Антал Т.К., Антонова И.И., Антоновская А.А., Антохина О.Г., Арифулин Е.А., Армеев Г.А., Артюшин И.В., Арушанян И.О., Ахметжанова А.А., Ашапкин В.В., Бабенко В.А., Бакеева Л.Е., Балацкий А.В., Банникова А.А., Баринова Н.Н., Баулина О.И., Бацевич В.А., Бедарева И.В., Белевич Т.А., Беме И.Р., Бенедиктов А.А., Березина Н.Я., Биланенко Е.Н., Бисерова Н.М., Благовещенская Е.Ю., Боброва В.К., Бондарева Э.А., Бондаренко Г.Н., Борисанова А.О., Брагина Е.Е., Брызгалина Е.В., Бубнова Е.Н., Бугров Д.И., Бушуев А.В., Бызов Б.А., Бычков А.Ю., Бычкова Е.Ю., Вайпан Д.В., Вайс В.Б., Вальехо-Роман К.М., Вангели И.М., Ванюшин Б.Ф., Варлыгина Т.И., Вархотов Т.А., Васильев А.Н., Васильева Е.Д., Васильева С.Г., Вилкул Е.А., Виноградова Е.Н., Виноградская М.И., Владыченская И.П., Водопьянов С.С., Волкова О.А., Волкова О.С., Волцит О.В., Воробьева Е.А., Воронина Е.Ю., Воронко О.В., Ворцепнева Е.В., Высоких М.Ю., Гавриленко С.М., Галинская Т.В., Галкин И.И., Галоян Э.А., Ганчарова О.С., Гаранина А.С., Георгиев А.А., Герасимов Е.С., Глаголева Е.С., Глушакова А.М., Гмошинский В.И., Гоголева С.С., Година Е.З., Головин А.В., Гололобова М.А., Гомыранов И.А., Горелова О.А., Горшкова Е.А., Горюнов Д.В., Гофман Д.К., Григорьев Ф.В., Григорьева А.А., Григорьева О.А., Грицышин В.А., Груздева М.А., Грум-Гржимайло О.А., Гусев Ф.Е., Данилович И.Л., Дегтярева Г.В., Диброва Д.В., Добров Б.В., Добровольская Т.Г., Дроздова О.Ю., Дуброва М.С., Дудов С.В., Дудова К.В., Дыйканов Д.Т., Дьяков М.Ю., Евтеев А.А., Ежова О.В., Екимова И.А., Еланский С.Н., Елумеева Т.Г., Емельянова Л.Г., Еремичев Р.Ю., Ерохина М.В., Ефименко А.Ю., Ефимов С.В., Жадан А.Э., Жирков И.А., Зайцева А.А., Захаров К.В., Землемерова Е.Д., Зернов А.С., Зубкова Е.Н., Иваненко В.Н., Иваницкая О.Н., Иваницкий В.В., Иванов А.О., Иванова А.Е., Игнатов М.С., Игнатова Е.А., Ильина И.Ю., Ильинская О.П., Калякин М.В., Камалов А.А., Карапетян М.К., Касумян А.О., Каткова Е.В., Качалкин А.В., Квятковский А.Л., Квятковский А.Я., Керимов А.Б., Климович П.С., Климчук О.И., Клёнова А.В., Кнорре Д.А., Князева А.А., Кобельков Г.М., Кобельков С.Г., Кокаева Л.Ю., Колбасов Г.А., Колбасова Г.Д., Колесниченко К.А., Кондакова О.А., Коновалова О.П., Конюхов И.В., Копылов-Гуськов Ю.О., Королев Д.Е., Королева А.Т., Корсуновская О.С., Коршунова Г.А., Коршунова Т.А., Кочкин Д.В., Кошелева Н.В., Крайнов В.Н., Крамина Т.Е., Кремнёв С.В., Криницына А.А., Крупицкий А.В., Крускоп С.В., Кручинин П.А., Кручинина А.П., Кузищин К.В., Кузнецов А.Г., Кулебякин К.Ю., Кулебякина М.А., Куприянова Е.В., Кураков А.В., Кутов Д.К., Кутуева Л.И., Кутузова И.А., Кушунина М.А., Лазарев Е.Н., Лапашина А.С., Лапыгина Е.В., Лебедев В.С., Левик Л.Ю., Лемак С.С., Леонтьева О.А., Лисенкова А.А., Лисовский А.А., Лобакова Е.С., Логачёва М.Д., Лопатина Ю.В., Лубнина Н.В., Лукашевич Н.В., Лукьянов А.А., Лысак Л.В., Лысков Д.Ф., Мазей Ю.А., Макарова Н.Е., Максимова И.А., Малахов В.В., Малютина А.М., Манахов А.Д., Манских В.Н., Манучарова Н.А., Маркина М.М., Маркова О.В., Марова-Кляйнбуб И.М., Мартынов А.В., Марфенина О.Е., Маслакова А.А., Мелихова Е.В., Мельникова М.Н., Милютина И.А., Михайлов К.В., Михайлов К.Г., Морковин А.А., Москаленко В.Н., Мохова Е.Н., Мулкиджанян А.Я., Мунтян М.С., Мурашев В.В., Мурашев И.А., Нагаев Б.Э., Назаров П.А., Назаров Р.А., Нанова О.Г., Недоспасов С.А., Неретин Н.Ю., Неретина Т.В., Нестеренко А.М., Нетрусов А.И., Никитин М.А., Николаева О.В., Нилова М.В., Нимирицкий П.П., Новаковский Г.Э., Новаковский Г.Э., Новоселецкая Е.С., Новоселецкий В.Н., Носов А.М., Оболенская Е.В., Овченков Е.А., Огурцов С.В., Озеров А.Л., Озрина Р.Д., Олейникова О.В., Олейникова О.В., Онипченко В.Г., Онищенко Г.Е., Орлов Д.С., Орловский И.В., Павлинов И.Я., Павлов Д.С., Павлов С.Д., Павлова Н.С., Панина О.Б., Панютина А.А., Парфёнова Е.В., Пенин А.А., Перехватов В.В., Петракова О.С., Петров Н.Б., Петров П.Н., Петушкова Ю.А., Пивоваров Е.А., Плетюшкина О.Ю., Плеханова О.С., Погосян С.И., Поздняков Л.А., Полевова С.В., Полилов А.А., Поляков М.П., Полянская Л.М., Попеленский Ф.Ю., Попкова Е.Г., Попов В.С., Попова Е.Н., Попова С.С., Поярков Н.А., Просвиров А.С., Птушенко В.В., Пугачева Т.Т., Рамонова А.А., Распопова А.А., Ревина Д.Б., Редькин Я.А., Решетников Р.В., Римская-Корсакова Н.Н., Рогаев Е.И., Романов А.А., Романова Е.С., Романова Е.С., Рубина К.А., Румянцев В.Ю., Русин Л.Ю., Русинов И.С., Рыжов А.Л., Рысенкова К.Д., Савилова З.Д., Савицкая М.А., Савицкий В.Ю., Савкин И.А., Савченко А.С., Самигуллин Т.Х., Самойлов К.Ю., Самоходская Л.М., Самсонов Т.Е., Северова Е.Э., Селях И.О., Семенова А.В., Семенова Л.Р., Семенова М.Л., Семин В.Н., Семина Е.В., Сенченков Е.П., Сенчукова А.Л., Серегин А.П., Сидоренко Г.Ю., Симоненко Е.Ю., Симонян Р.А., Синев А.Ю., Скулачев В.П., Скулачев К.В., Слободкина Е.А., Смирнова Е.А., Соловченко А.Е., Соловьева Е.Н., Сорокин М.И., Сото Э., Спасская Н.Н., Сперанская А.С., Спирин С.А., Стамбольский Д.В., Старостина Е.Е., Степанов А.Л., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Сумбатян Н.В., Суханова Е.С., Сухоруков А.П., Сысоева В.Ю., Тарнопольская М.Е., Тащилова А.С., Твердислов В.А., Темерева Е.Н., Терентьева Е.И., Терехова В.А., Тимошенко В.Ю., Титова М.В., Тихонов В.В., Тишечкин Д.Ю., Токарчук А.В., Томкович П.С., Троицкий А.В., Тужилин А.А., Тузов К.А., Федоров А.В., Федоров В.В., Федорова А.В., Федосеева (Бандолина) Е.В., Федосов В.Э., Фенюк Б.А., Фетисова Е.К., Флегонтов П.Н., Фырнин Д.М., Хайлова Л.С., Храмова Ю.В., Цетлин А.Б., Чеканов К.А., Челомбитько М.А., Черепанов Д.А., Чернов И.Ю., Черняк Б.В., Чертополохов В.А., Чертопруд Е.С., Чесунов А.В., Чивкунова О.Б., Чотчаева Ф.Р., Чубатова Н.В., Чудаев Д.А., Чурикова О.А., Шагиева Г.С., Шайтан А.К., Шайтан К.В., Шалаева Д.Н., Шаранова Н.Э., Шаталкин А.И., Шаталова Н.Н., Шафеи Р.А., Шахпаронов В.В., Шведчикова Н.К., Шестаков А.И., Шилов Е.С., Шиловский Г.А., Шнырева А.В., Штратникова В.Ю., Шубина Е.А., Шуленина Н.Э., Щелкунов М.И., Щербаков П.Н., Эльдаров Ч.М., Юрцева О.В., Яворская М.И., Яковенко С.А., Якушев А.В., Якушев А.Г., Яровая Е.Б.
  • • 1 января 2015 - 31 декабря 2015 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физических, физико-химических, биофизических и медицинских проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Савкин И.А., Сулимов А.В.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2016 Высокопроизводительные технологии моделирования релаксационных процессов в наноструктурированных тонких пленках
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Участники НИР: Горох А.А., Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Кочиков И.В., Лукьяненко Д.В., Смирнова Е.Н., Сулимов А.В., Сулимов В.Б., Шарапова С.А., Шаров А.Н.
  • • 1 января 2014 - 31 декабря 2014 Разработка и применение высокопроизводительных вычислительных методов молекулярного моделирования для решения физико-химических и био-физических проблем
    • 4.05.Лаборатория вычислительных систем и прикладных технологий программирования
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Григорьев Ф.В., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Оферкин И.В., Романов А.Н., Сулимов А.В.
  • • 1 января 2014 - 28 февраля 2014 Исследование способов реализации технологии облачных вычислений в современных типовых информационных системах.
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Участники НИР: Антонов А.С., Арушанян О.Б., Бухштаб Д.А., Воеводин В.В., Гончарский А.В., Горох А.А., Григорьев Ф.В., Еремеева Г.В., Ковалев А.Д., Козлов И.В., Кокарев М.А., Кондакова О.А., Медведев В.Н., Морковин С.Е., Никитенко Д.А., Ососков А.Г., Починок И.В., Руденко Н.М., Серов В.А., Сидоров И.Ю., Симонова Н.А., Смирнов А.В., Смирнова Е.Н., Соболев С.И., Сулимов В.Б., Тимохов А.В., Харитонов Е.А., Шарапова С.А., Шоков В.Н.
  • • 14 июня 2012 - 7 сентября 2013 Суперкомпьютерное моделирование процессов напыления материалов с оптоэлектронными свойствами для технологий получения оптических нанопокрытий
    • 4.14.Лаборатория вычислительного эксперимента и моделирования
    • Руководитель: Тихонравов А.В. Участники НИР: Горох А.А., Григорьев Ф.В., Каткова Е.В., Козлов И.В., Кондакова О.А., Кочиков И.В., Серов В.А., Сулимов В.Б., Шарапова С.А.
  • • 19 августа 2011 - 10 ноября 2012 Создание сверхмасштабируемой программы для молекулярного моделирования солнечных батарей
    • Научно-исследовательский вычислительный центр
    • Руководитель: Сулимов В.Б. Участники НИР: Втюрина Д.Н., Григорьев Ф.В., Жабин С.Н., Каткова Е.В., Кондакова О.А., Кутов Д.К., Масленников Е.Д., Оферкин И.В., Романов А.Н., Сулимов А.В., Федулов К.М.
  • • 1 мая 2010 - 31 декабря 2012 Разработка и реализация эффективных алгоритмов глобальной оптимизации на высокопроизводительных вычислительных системах
    • Научно-исследовательский вычислительный центр
    • Руководитель: Кондакова О.А. Участники НИР: Головачева А.Ю., Каткова Е.В., Оферкин И.В., Сулимов А.В.

• Свидетельства о регистрации прав на программное обеспечение

  • • 2013 "MILOR" (тип не указан)
    • Авторы: Григорьев Ф.В., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Тихонравов А.В.
    • #2013616705, 17 июля
  • • 2009 «PLISDOCK» (тип не указан)
    • Авторы: Дордопуло А.И., Левин И.И., Сорокин Д.А., Романов А.Н., Кондакова О.А., Сулимов В.Б., Оферкин И.В.
    • #2009614741, 3 сентября

• Участие в программных комитетах конференций

  • • 23-24 сентября 2019 Суперкомпьютерные дни в России 2019
    • Член организационного комитета
    • Москва, Россия

• Руководство дипломными работами

  • • 2009 Поиск новых противоопухолевых веществ методами молекулярного дизайна
    • Научные руководители: Сулимов В.Б., Кондакова О.А., Романов А.Н.
    • Автор: Втюрина Дарья Николаевна (Специалист)

---