Аннотация:Исследована задача фолдинга белка для прогнозирования его трехмерной структуры. Для этого использованы нейронные сети с архитектурой AlphaFold и множественным выравниванием последовательностей. Проведен обзор задач биоинформатики. Особенностью подхода к решению задачи является использование топологических инвариантов. Приведено краткое изложение используемой теории этих инвариантов. Описаны существующие решения для оценки трехмерной структуры. Для решения задачи проведены вычислительные эксперименты. Проведен анализ результатов вычислительных экспериментов известных архитектур