Модификация пространственной структуры локуса HOXD посредством привлечения транкированной формы белка CTCF - дипломная работа | ИСТИНА – Интеллектуальная Система Тематического Исследования НАукометрических данных

Научные руководители: Ульянов С.В., Тюкачева Е.А.
Автор: Антонов Г.Н.
Тип: Бакалавр
Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
Год защиты: 2024
Аннотация: С развитием методов захвата конформации хроматина, стала очевидна большая роль архитектуры генома в работе базовых молекулярно-биологических процессов клетки. Нарушения в пространственной организации генома могут приводить к значительным изменениям экспрессии генов, что отражается на физиологии как отдельных клеток, так и на функционировании целого организма. Последнее может в ряде случаев приводить к развитию патологий. В связи с этим встал вопрос о возможности направленной модификации пространственной структуры хроматина методами эпигенетической инженерии. На экспрессию генов во многих локусах влияют взаимодействия с различными регуляторными элементами. Такие взаимодействия становятся возможными благодаря формированию хроматиновых петель между таргетным геном и его энхансером/сайленсером. Одним из наиболее достоверных механизмов формирования петель является экструзия, главными участниками в которой являются белки когезин и CTCF. Именно роли последнего в вышеупомянутом процессе отчасти и посвящена эта работа. Целью данной работы является исследование возможности изменения эпигенетического контекста и трёхмерной организации локуса HoxD путём привлечения химерного белка N+2ZF-dCas9-EGFP. Для достижения этой цели сформулированы следующие задачи: 1. Подобрать gRNA внутрь локуса HoxD в пределах участка, покрытого белками Polycomb, и собрать плазмиды phU6, содержащие gRNA. 2. Проверить возможность связывание с ДНК химерного белка N+2ZF-dCas9-EGFP посредством электропорации культуры K562 плазмидами, кодирующими химерный белок и gRNA, с последующим анализом методом ChIP-qPCR с антителами к N-концевому домену CTCF и к GFP. 3. Кроме того, построить карту пространственных взаимодействий локуса HoxD в популяции клеток, трансфецированных плазмидами, несущими химерный белок и gRNA; проанализировать изменение, вызванное привлечением фрагмента белка CTCF в таргетный локус.
Добавил в систему: Ульянов Сергей Владимирович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ПсковГУ
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ПсковГУ

Модификация пространственной структуры локуса HOXD посредством привлечения транкированной формы белка CTCFдипломная работа (Бакалавр)

Прикрепленные файлы