ИСТИНА

В данной работе мы описываем предсказание оптических спектров различных семейств мутантов GFP на основе траекторий, полученных в рамках молекулярной динамики (МД) с потенциалами комбинированного метода квантовой и молекулярной механики (КМ/ММ). Дескрипторами служат как различные геометрические характеристики, так и электростатический потенциал от окружающих хромофор остатков белка. В основе нашего подхода- предсказание распределение вариации дипольного момента (DMV), определение коэффициентов квадратичного эффекта Штарка при установлении соответствия экспериментальному спектру с помощью оптимизации метрики Вассерштайна, ставя изначальные дескрипторы в однозначное соответствие с точками экспериментального спектра, открывая возможности для создания предсказательных машинных моделей.