![]() |
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ПсковГУ |
||
В работе представлены результаты исследования таксономического состава диатомовых пиководорослей льда Белого моря с использованием метагеномного подхода. Амплификация проведена с праймерами на область V4 гена 18S рРНК, секвенирование выполнено на платформе «Illumina». Во льду выявлены ОТЕ, имеющие сходство более 99% с такими представителями пикодиатомей как Minutocellus polymorphus (LC189088) и Skeletonema marinoi (KR091067). M. polymorphus и S. marinoi ранее не были отмечены в составе как ледовой флоры, так и планктона Белого моря. Также обнаружены последовательности неопределенных до вида представителей родов Thalassiosira и Chaetoceros, которые были на 99% идентичны депонированным в NCBI Thalassiosira sp. CCMP353 (DQ514871) и Chaetoceros sp. RCC4286 (KT884469). Среди родов Thalassiosira и Chaetoceros есть виды с размерами < 3 мкм, поэтому не следует исключать возможность того, что выявленные во льдах Белого моря Thalassiosira sp. и Chaetoceros sp. могут относиться к пикофракции. Ряд обнаруженных последовательностей в одинаковой степени (>98%) были сходны с последовательностями трех видов рода Skeletonema: S. japonicum (AB948145), S. grethae (FR865519) и S. costatum CCAP1077/4 (AY684949). Надежно разделить виды Skeletonema только на основе V4 участка 18S rRNA гена не представляется возможным. Минимальные размеры S. japonicum и S. grethae соответствуют пикофракции, а S. costatum – выходят за рамки пикоформ. Соответственно, список пикодиатомей льдов Белого моря может включать S. japonicum или S. grethae. Либо, если выявленные последовательности соответствуют S. costatum, то из рода Skeletonema только S. marinoi будет являться представителем пикофракции. Несколько последовательностей в одинаковой степени (>99%) были сходны с последовательностями видов Thalassiosira angulata (KF454006), T. oestrupii var. venrickae CC03-15 (DQ514870) и Minidiscus trioculatus (FJ590769). Из этих трех видов минимальные размеры только у Minidiscus trioculatus соответствуют пикофракции и, возможно, эта водоросль, входит в состав пикодиатомей льдов Белого моря.