ИСТИНА

Изучение влияния посттрансляционных модификаций на структуру и функции белков - актуальная область молекулярной биологии. К числу наиболее распространённых и значимых модификаций относится фосфорилирование, влияющее на функциональную активность и структуру белковых молекул. На поверхности клеток дрожжей присутствует глюкантрансфераза Bgl2p, необходимая для устойчивости этих микроорганизмов в условиях стресса. Были получены данные о наличии двух пулов Bgl2p с различным способом закрепления в клеточной стенке - пула молекул без фосфорилирования (Bgl2P-) и с фосфорилированием по Thr84 (Bgl2P), проявляющих ферментативную активность, и другого пула малоактивных молекул с фосфорилированием, предположительно 11 аминокислотных остатков: три Ser, семь Thr и один Tyr (Bgl2P11). Выдвинута гипотеза, согласно которой Bgl2P- и Bgl2P, в отличие от множественно фосфорилированного Bgl2P11, сохраняют структуру активного центра. Для ее проверки были получены расчёты траекторий длинной 100 нс методом молекулярной динамики для Bgl2P-, Bgl2P и Bgl2P11 в силовом поле CHARMM36 с использованием модели воды TIP3P в 0.12M NaCl. Контролем являлась структура Bgl2P-, построенная по гомологии по шаблону 4wtp.1 и оптимизированная программой Robetta. Структуры для Bgl2P11 и Bgl2P получены с помощью программы Pymol, плагина PTMs. При сравнительном анализе траекторий, были установлены статистически значимые отличия в стабильности структуры Bgl2P11 от Bgl2P и Bgl2P-. Bgl2P11 значительно изменял свою конформацию в ходе моделирования, при этом конформационные изменения, в отличие от Bgl2P и Bgl2P-, в том числе происходили в области активного центра. Работа поддержана грантом РФФИ 20-04-01144. Выражаю благодарность ведущим научным сотрудникам Калебиной Т. С. и Шайтану А. К.